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xifan02新蟲 (初入文壇)
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MS里三斜晶系的坐標(biāo)導(dǎo)入lammps里有變化
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我想把在MS里建的HCP結(jié)構(gòu)導(dǎo)入lammps計(jì)算。如果建的是正交的HCP,那么導(dǎo)出后原子的坐標(biāo)和在MS里的實(shí)際坐標(biāo)(即不是分?jǐn)?shù)的那個(gè)坐標(biāo))是一樣的?墒钱(dāng)我建三斜的HCP結(jié)構(gòu)時(shí),導(dǎo)出的坐標(biāo)與MS里的實(shí)際坐標(biāo)完全不同。 在MS里,建的三斜晶體的坐標(biāo)是 (括號(hào)里是對(duì)應(yīng)的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)) 1 1 0 0 0 (0 0 0) 2 1 0.771363 4.45060 5.61922 (1/6 5/6 1/2) 3 1 1.54273 2.26725 1.71039 (1/3 1/3 0) 4 1 2.31409 1.74238 4.76403 (1/2 1/6 1/2) 5 1 3.08545 4.53449 3.42077 (2/3 2/3 0) 6 1 3.85681 4.00962 6.47441 (5/6 1/2 1/2) 導(dǎo)出來(lái)之后就變成了 1 1 0 0 0 2 1 4.66499 4.848 2.591 3 1 2.79899 1.616 0 4 1 4.66499 1.616 2.591 5 1 5.59799 3.232 0 6 1 7.46398 3.232 2.591 感覺(jué)是跟著分?jǐn)?shù)坐標(biāo)在走。 這是什么原因,有什么解決辦法嗎? |
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