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Ergon金蟲 (著名寫手)
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[求助]
粗;U埥--如何搭建可在lammps運行的模型 已有1人參與
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各位大神,小弟想要做些粗;矫娴哪M。有個論文是模擬粗;┑。高了好些天模型沒搭建好。 想問的問題是怎么搭建粗粒化模型?軟件? (PS小弟曾用materials studio搭建了一個石墨烯的粗粒化模型跟圖片像是,但是導(dǎo)出car格式的數(shù)據(jù)沒有坐標等信息) 石墨烯粗;.GIF |


新蟲 (著名寫手)
| 粗粒化的思想說起來是很簡單的,但是具體做起來,尤其是具體到某一種物質(zhì)的時候就變得比較復(fù)雜。難點1、如何搭建好粗;P停茨悻F(xiàn)在遇到的問題,通常是根據(jù)實驗結(jié)果和經(jīng)驗或者嘗試而完成的,即常說的粗;成洹ky點2、粗;瘎莺瘮(shù)的構(gòu)造也就是我們常說的力場。這個可以說是搭建的力場在不影響模擬結(jié)果的前提下越簡單越好。難點3,當有較好的力場時,我們還要考慮模型之間的信息傳遞,即常用的方法有MS-CG,RMC\IBM和RE等,這可以理解為勢能函數(shù)的參數(shù)優(yōu)化處理。然后才是利用所建粗粒模型來研究體系的性質(zhì)。這里的1、2主要依賴于經(jīng)驗和直覺(可以利用已有文獻結(jié)果)3,主要是理論分析和數(shù)學(xué)方法的選擇(MS-CG,RMC\IBM和RE)。4、較為簡單,就是模擬需要的結(jié)果。若借助于已有的軟件可能會簡單許多,前提是,有軟件,會用軟件。我沒有用軟件,所以不敢多說,但是在文獻中大多都是lammps、VOTCA和gromacs。 |
新蟲 (初入文壇)
您好,我正好要用MS粗;,新手花了好久摸不到頭緒,可以指點下我具體實操,或者發(fā)一份您模擬的石墨烯粗;募轿亦]箱zbr1057856363@163.com嗎,感激不盡![]() |
新蟲 (初入文壇)
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