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子非魚(yú)不知魚(yú)銀蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
如何預(yù)測(cè)植物病毒外殼蛋白的抗原表位
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最近老師讓做一個(gè)課題是先要找到植物病毒外殼蛋白上的抗原表位然后克隆表達(dá)，但是我查資料以后還是有很多東西不懂，希望大家能幫助我 1.做抗原表位預(yù)測(cè)好像很多方法是B細(xì)胞抗原表位預(yù)測(cè)及T細(xì)胞抗原表位預(yù)測(cè)，但是我不懂植物應(yīng)該沒(méi)有B和T細(xì)胞吧，那做這個(gè)預(yù)測(cè)是不是沒(méi)有用呢？ 2.那植物病毒的抗原表位預(yù)測(cè)用什么方法或者軟件比較好？或者說(shuō)，怎么找到抗原性較強(qiáng)的肽段？ 3.我查找資料發(fā)現(xiàn)，不管做抗血清的制備或者抗病毒轉(zhuǎn)基因植物都用的是整個(gè)外殼蛋白做克隆表達(dá)，所以我不清楚，老師讓我找到抗原性比較強(qiáng)的肽段有必要嗎？或者是有其他用途嗎？ 4.植物病毒用原核表達(dá)系統(tǒng)還是用真核表達(dá)系統(tǒng)有區(qū)別嗎？我看文獻(xiàn)上大多用原核表達(dá)，但是我怎么覺(jué)得用真核好一點(diǎn)，畢竟病毒是作用植物上啊 5.因?yàn)閷?shí)驗(yàn)室沒(méi)有提純的病毒，也就木有模板做PCR擴(kuò)增，那我要人工合成這段序列是不是非常難和麻煩？請(qǐng)問(wèn)有哪位有方案可以參考一下嗎？ 本人比較小白，麻煩大家了，金幣我會(huì)盡量送的 |
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2樓2015-02-15 21:15:25
3樓2015-02-15 21:18:18
子非魚(yú)不知魚(yú)
銀蟲(chóng) (初入文壇)
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4樓2015-02-15 21:23:28
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5樓2015-02-16 10:19:13
【答案】應(yīng)助回帖
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為了獲取識(shí)別天然蛋白的抗體，有兩種方式可以選擇。一種是利用重組蛋白的方式獲取盡可能接近天然條件下的重組蛋白，然后刺激試驗(yàn)動(dòng)物免疫系統(tǒng)，進(jìn)而獲取相應(yīng)抗體。這種方式獲取抗體的成功率較高且效價(jià)較好；另一種是預(yù)測(cè)天然蛋白的抗原決定簇，這種抗原決定簇最終體現(xiàn)為多肽形式，將其與相應(yīng)的載體偶聯(lián)后刺激試驗(yàn)動(dòng)物免疫系統(tǒng)，也可以獲取相應(yīng)的抗體。 資料網(wǎng)址：http://www.detaibio.com/peptide-antigen-prediction.html |
6樓2015-02-28 09:29:58
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