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bojanchang銀蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
如何根據(jù)miRNA的序列預(yù)測(cè)其靶基因，有推薦的軟件或網(wǎng)址嗎 已有1人參與
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實(shí)驗(yàn)室根據(jù)miRNA表達(dá)譜鑒定到幾個(gè)Noval的miRNA，后面想做這些Noval的靶基因預(yù)測(cè)，我發(fā)現(xiàn)一些靶基因預(yù)測(cè)的網(wǎng)站數(shù)據(jù)庫(kù)都針對(duì)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的miRNA，像我這種情況，只知道Noval miRNA的序列，預(yù)測(cè)其靶基因用哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)比較好��？ 還請(qǐng)大家指點(diǎn)，分享一下經(jīng)驗(yàn)，不勝感激！ |
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xingzhou823
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常用的英文數(shù)據(jù)庫(kù)有 TargetScan、miRanda、MirTarget2、PicTar、PITA等。 另外，新手的話可以使用中文的web-service，簡(jiǎn)單實(shí)用，上手快捷。例如“云生信”http://www.biocloudservice.com。 |
2樓2015-03-20 13:10:03
bojanchang
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3樓2015-03-23 09:09:13
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你做的是植物的miRNA預(yù)測(cè)嗎？psRNATarget是預(yù)測(cè)植物的。 之前我說(shuō)的軟件targetscan miranda是可以本地化的�？梢宰约哼\(yùn)行程序預(yù)測(cè)新miRNA的靶基因。 |
4樓2015-03-23 13:16:27
bojanchang
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5樓2015-03-24 16:33:03
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6樓2015-09-24 09:42:27
| 請(qǐng)問(wèn)您有相關(guān)的本地預(yù)測(cè)軟件沒(méi)有，我剛進(jìn)行高通量測(cè)序，也有想做的候選基因，但是沒(méi)有相關(guān)的本地預(yù)測(cè)軟件安裝包，請(qǐng)問(wèn)您能不能發(fā)我一下（郵箱：liuhongzhu2017@outlook.com）,感激不盡！ |
7樓2018-08-29 22:48:13
bioinfo_gg
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8樓2018-10-18 09:35:36
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