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16S rRNA宏基因組測序策略討論
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大家都知道單克隆可以用RNA引物擴(kuò)增rRNA,然后用挑克隆做3730測序,如果是項(xiàng)目做16s rRNA宏基因組測序,大家會用什么測序策略: 1、RNA引物擴(kuò)增成cDNA,打斷到300bp左右(或者用區(qū)域引物擴(kuò)增目的區(qū)域)然后加上測序接頭,上MiseqPE300 2、RNA轉(zhuǎn)錄前打斷成300nt左右,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,加上pcr-free接頭,上 Miseq 我是想到這兩種比較合適,大家有什么建議? |
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