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Cute_Dolphin新蟲 (初入文壇)
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[求助]
細(xì)菌全基因組序列上傳到NCBI 已有1人參與
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| 本人用第二代測序(Illumina)獲得一株細(xì)菌的全基因組序列,現(xiàn)想將序列上傳到NCBI,由于剛接觸生物信息這塊,不太了解,想知道把數(shù)據(jù)上傳到NCBI需要一些什么信息,除了基因序列外,是不是需要每個(gè)基因的詳細(xì)功能注釋?注釋又有哪些要求呢?求大神指點(diǎn),最好給出具體的步驟,也希望能推薦一些好用的軟件,謝謝。 |
銀蟲 (正式寫手)
| 仔細(xì)看NCBI的Submission Portal提交網(wǎng)頁,基因組提交,可以直接提交裸序列,也可以提交基因注冊(cè)信息,或者你可以直接用NCBI的自動(dòng)注釋系統(tǒng)進(jìn)行基因注釋,再提交也可以。你可以參考我們提交草圖基因組的流程:http://www.microbialgenomic.com/微生物基因組分析中心_培訓(xùn)講義.html |

鐵桿木蟲 (著名寫手)
銀蟲 (正式寫手)

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