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王小妞_haha新蟲 (初入文壇)
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[求助]
pdb2gmx執(zhí)行效率這么慢？
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| 各位大俠，我是剛剛開始學(xué)習(xí)gromacs. 我從網(wǎng)上找個(gè)簡單的例子想學(xué)習(xí)一下整個(gè)模擬過程。找的例子是模擬水環(huán)境下的小肽鏈。資料上上說這個(gè)模擬大概10分鐘就能完成。我下載了1F95.pdb文件，然后就執(zhí)行pdb2gmx -f 1F95.pdb -o 1F95.gro -p 1F95.top > output.pdb2gmx命令，但是光這個(gè)命令就跑了10多個(gè)小時(shí)，還沒有出結(jié)果，就是沒有出現(xiàn)$>這樣的提示輸入新的指令。但是電腦資源管理器看CPU和內(nèi)存的使用率都很低，我想請教一下這個(gè)指令就是要跑很久呢？還是我在ubuntu下裝的gromacs有問題呢？請多多指教！不勝感激！ |
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