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談判陶榮譽(yù)版主 (文壇精英)
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《讀懂天然產(chǎn)物》系列-17-宿主與寄生菌的“愛(ài)情保養(yǎng)”-"小三"你走開 已有1人參與
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《讀懂天然產(chǎn)物系列》淘帖鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/taotie.php?action=view&ttid=55868歡迎各位蟲友前往閱讀、訂閱! 動(dòng)植物內(nèi)生菌與宿主之間的“互利互惠”(愛(ài)情故事)關(guān)系已逐漸為大家熟悉,關(guān)于這方面的報(bào)道也越來(lái)越多,本次評(píng)述重點(diǎn)介紹兩篇關(guān)于內(nèi)生菌與宿主如何維護(hù)這種生生世世的“戀情”的文章: [1] Jarrod J. Scott, Dong-Chan Oh, M. Cetin Yuceer, Kier D. Klepzig, Jon Clardy, Cameron R. Currie. Bacterial Protection of Beetle-Fungus Mutualism [J], Science, 2008, 322: 63. [2] Dong-Chan Oh, Michael Poulsen, Cameron R Currie, Jon Clardy, Dentigerumycin: a bacterial mediator of an ant-fungus symbiosis [J], Nature Chemical Biology, 2009, 5: 391-393. 這兩篇文章均是由Harvard Medical School與University of Wisconsin-Madison的兩位Jon Clardy 和Cameron R Currie合作完成,這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室分別致力于“how small molecules control biological processes” 和 “the symbiotic associations between animals and microbes” 的研究,關(guān)于這兩位大牛的文章有很多,大家如有感興趣的地方可以進(jìn)一步查找。 第一篇文章: 引入: 根據(jù)前期的文獻(xiàn)調(diào)研發(fā)現(xiàn),南方松樹甲蟲Dendroctonus frontalis與其共生真菌Entomocorticium sp. A在過(guò)著幸福生活的時(shí)候容易被“小三”競(jìng)爭(zhēng)性真菌Ophiostoma minus抑制,從而破壞它們之間的“完美愛(ài)情”。作者通過(guò)電鏡掃描(SEM)發(fā)現(xiàn)在南方松樹甲蟲的貯菌器(mycangium)中存在大量的放線菌,進(jìn)而推測(cè)這些放線菌是保衛(wèi)它們“愛(ài)情”的關(guān)鍵。 文中的主角關(guān)系如圖一所示: 正文: 作者從110個(gè)甲蟲群采集分離得到846個(gè)放線菌菌落,從中選擇了164 個(gè)菌落轉(zhuǎn)接到純培養(yǎng)基中,通過(guò)觀察以及DNA序列分析證實(shí)外觀上主要分為“紅色”與“白色”兩種,進(jìn)一步通過(guò)symbiont pairing bioassays實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)紅色外形的菌落提取物可以抑制“小三”拮抗菌 Ophiostoma minus, 而對(duì)正常共生菌Entomocorticium sp. A僅有輕微的影響,接下來(lái)通過(guò)分離提取、結(jié)構(gòu)鑒定得到化合物mycangimycin,化合物mycangimycin的結(jié)構(gòu)解析發(fā)表在Org Lett. 2009, 11(3):633-636 (附件中文獻(xiàn)[3])。實(shí)驗(yàn)流程如圖二所示: 作者得到純化合物mycangimycin后,通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)之前的推測(cè)進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)mycangimycin對(duì)“小三”O(jiān)phiostoma minus ( MIC= 1.0 μM)的殺傷力接近是正常共生真菌Entomocorticium sp. A( MIC= 19.0 μM)的20倍! 此外,化合物mycangimycin對(duì)其他的一些真菌也具有較強(qiáng)的殺傷力,如圖三所示: 第二篇文章: 引入: 第二篇文章的整體思路與第一篇類似,其研究對(duì)象由“南方松樹甲蟲-真菌”共生系統(tǒng)變?yōu)椤拔浵?真菌”共生系統(tǒng), “螞蟻-放線菌”共生系統(tǒng)一直是倍受關(guān)注的共生系統(tǒng),具有以下三個(gè)特點(diǎn):(1).進(jìn)化的多樣性使的“螞蟻-放線菌”共生的螞蟻種類有超過(guò)230種,提供了一個(gè)多分支的進(jìn)化體系;(2).不同環(huán)境“螞蟻-真菌”共生系統(tǒng)中的真菌種類多樣,包括Basidiomycota, Agaricales: Lepiotaceae and Pterulaceae;(3).前期研究表明螞蟻共生的Pseudonocardia spp.可以選擇性的產(chǎn)生抗生素來(lái)抑制特定的入侵寄生真菌Escovopsis spp.但是尚未有文獻(xiàn)對(duì)這些抗生素的具體結(jié)構(gòu)進(jìn)行報(bào)道。 正文: (1) 活性追蹤: 運(yùn)用LC-MS從 Pseudonocardia spp菌株發(fā)酵液提取物中發(fā)現(xiàn)一個(gè)主要成分,進(jìn)一步活性追蹤分離得到化合物dentigerumycin。 (2) 結(jié)構(gòu)確定: 結(jié)合1H, 13C NMR gCOSY, TOCSY, gHSQC 和gHMBC NMR確定該化合物的平面結(jié)構(gòu),根據(jù)ROESY確定其相對(duì)構(gòu)型,dentigerumycin的絕對(duì)構(gòu)型是這篇文章的重點(diǎn)描述的內(nèi)容,從結(jié)構(gòu)中來(lái)看dentigerumycin包括7個(gè)結(jié)構(gòu)片段:2個(gè)piperazic acid 片段,1個(gè)γ-OH-Pip,1個(gè)丙氨酸Ala,1個(gè)N-OH-Ala,1個(gè)β-OH-Leu以及一個(gè)Acyl side chain。其中Pip-1, Pip-2, Ala和β-OH-Leu中的手性中心直接通過(guò)Marfey試劑來(lái)判斷,N-OH-Ala通過(guò)化學(xué)轉(zhuǎn)化為N-H-Ala也可以通過(guò)Marfey試劑判斷其絕對(duì)構(gòu)型(具體方法請(qǐng)參考附件中文獻(xiàn)[4]);γ-OH-Pip通過(guò)Mosher試劑確定7位的絕對(duì)構(gòu)型為7S,Acyl side chain上的鄰二醇手性中心(29, 30)作者采用醋酸鉬誘導(dǎo)的激子手性法來(lái)確定,進(jìn)一步通過(guò)相對(duì)構(gòu)型來(lái)判斷33, 34位的絕對(duì)構(gòu)型為33S, 34R. (3) 活性驗(yàn)證:由于化合物dentigerumycin是通過(guò)活性追蹤得到的,因此此對(duì)dentigerumycin的抑菌活性進(jìn)行驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)表明dentigerumycin對(duì)入侵寄生真菌Escovopsis spp.的殺傷力為MIC= 2.8 μM,而對(duì)正常寄生真菌的殺傷力較弱;與此同時(shí)對(duì)野生型Candida albicans ATCC10231 和對(duì)兩性霉素耐藥的Candida albicans ATCC200955 具有較強(qiáng)的抑制作用(MIC = 1.1μM)。 討論: 1. 如果有一天"小三"對(duì)愛(ài)情守護(hù)者"的“武器“-抗生產(chǎn)耐受性,宿主和共生菌這對(duì)伴侶肯定會(huì)尋找新的"抗生素"來(lái)維護(hù)這段愛(ài)情,在超級(jí)細(xì)菌問(wèn)題日益嚴(yán)重的今天,那我們是否可以運(yùn)用這個(gè)模型來(lái)篩選對(duì)抗超級(jí)細(xì)菌的化合物呢? 2. 第一篇文章是2008年發(fā)表的,2009年作者把第一篇文章里的mycangimycin結(jié)構(gòu)解析部分單獨(dú)發(fā)表在OL上,大家覺(jué)得這是一稿多投嗎? 以上即為本人對(duì)這兩篇文獻(xiàn)的簡(jiǎn)單看法,相關(guān)文獻(xiàn)請(qǐng)見附件!由于專業(yè)的局限性,一定有很多不足,請(qǐng)各位蟲友見諒,并提出寶貴意見,謝謝! 《讀懂天然產(chǎn)物系列》淘帖鏈接:http://www.gaoyang168.com/bbs/taotie.php?action=view&ttid=55868歡迎各位蟲友前往閱讀、訂閱! 上一帖:《讀懂天然產(chǎn)物》系列-16-皮氏反應(yīng)催化生物堿合成的“神奇之旅” http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=8635520&fpage=1 |
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