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L_先森新蟲 (初入文壇)
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[求助]
VMD的Fit功能的使用
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請各位大神指點一個問題。! 本人用VMD軟件的Fit功能,希望將現(xiàn)有的顆粒結(jié)構(gòu)與FCC結(jié)構(gòu)相比較,求結(jié)構(gòu)的均方根偏差RMSD。但目前發(fā)現(xiàn),利用Align只能將顆粒結(jié)構(gòu)與FCC結(jié)構(gòu)樣本的質(zhì)點平移到一起,好像沒有將結(jié)構(gòu)旋轉(zhuǎn)去尋找最佳的匹配位置。如何才能將需要比較的兩個結(jié)構(gòu)以質(zhì)心為原點去旋轉(zhuǎn)尋找最佳的匹配位置,并求出最小均方根偏差? 請大家多多指點~ |
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