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jiguogeng銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
求助：我的dmol計算腳本，只能進行結構優(yōu)化，不能進行態(tài)密度和能帶結構等性質(zhì)計算。
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具體的腳本如下： #PBS -N 1020110a #PBS -l nodes=4:ppn=18 #PBS -j oe #PBS -l walltime=1000:00:00 ##export MPI_ROOT=/opt/soft/hpmpi ##export PATH=$PATH:/opt/soft/hpmpi/bin ##export DMOL_TMP=~/scratch ##export TMPDIR=$DMOL_TMP export MS_INSTALL_ROOT=/public/software/accelrys/Accelrys/MaterialsStudio7.0 export DMOL3_DATA=$MS_INSTALL_ROOT/share/Resources/Quantum/DMol3 export Castep_DATA=$MS_INSTALL_ROOT/share/Resources/Quantum/Castep export LD_LIBRARY_PATH=/public/software/accelrys/Accelrys/LicensePack/linux/lib:$LD_LIBRARY_PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MS_INSTALL_ROOT/lib:$LD_LIBRARY_PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MS_INSTALL_ROOT/lib/32:$LD_LIBRARY_PATH export PATH=/public/software/accelrys/Accelrys/MaterialsStudio7.0/bin:$PATH export PATH=$PATH:$MS_INSTALL_ROOT/etc/CASTEP/bin export PATH=$PATH:$MS_INSTALL_ROOT/etc/DMol3/bin source /public/software/accelrys/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile cd $PBS_O_WORKDIR echo $PBS_O_WORKDIR |tee ./History.log echo my job id is $PBS_JOBID | tee -a ./History.log echo run nodes is following: | tee -a History.log cat $PBS_NODEFILE | tee -a History.log echo begin time is `date` | tee -a History.log ###EXEC=/public/software/accelrys/Accelrys/MaterialsStudio7.0/etc/DMol3/bin/RunDMol3.sh EXEC=/public/software/accelrys/Accelrys/MaterialsStudio7.0/bin/dmol3.exe Inputfile=1020110a NP=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` ##cat $PBS_NODEFILE > /tmp/nodefile.$$ /public/software/accelrys/Accelrys/MaterialsStudio7.0/bin/mpiexec.hydra -f $PBS_NODEFILE -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP $EXEC $Inputfile 2>&1 | tee -a History.log echo end time is `date` | tee -a History.log ##rm -f /tmp/nodefile.$$ |
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