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[求助]
heatmap 圖解讀 已有1人參與
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做了微生物的高通量測(cè)序，公司又給了heatmap圖，想請(qǐng)教大俠們這個(gè)圖怎么解讀呢， 有沒(méi)有什么比較好的文獻(xiàn)或是學(xué)習(xí)資料可以推薦的呢，謝謝了 |
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2樓2015-05-12 21:08:18
3樓2015-05-12 22:12:33
靜雯
銀蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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- 蟲(chóng)號(hào): 2364113
- 注冊(cè): 2013-03-20
- 專業(yè): 抗腫瘤藥物藥理
【答案】應(yīng)助回帖
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Heatmap 可以用顏色變化來(lái)反映二維矩陣或表格中的數(shù)據(jù)信息，它可以直 觀地將數(shù)據(jù)值的大小以定義的顏色深淺表示出來(lái)。常根據(jù)需要將數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類， 將聚類后的數(shù)據(jù)表示在heatmap 圖上，通過(guò)顏色的梯度及相似程度來(lái)反映數(shù)據(jù) 的相似性和差異性。如在屬水平上對(duì)樣品和 OTU 類型（樣品所含菌屬）進(jìn)行聚 類（依據(jù)是不同樣品中各 OTU 所含序列數(shù)越相近，即所含菌屬數(shù)量越相近，樣 品間相似性越高） ，對(duì)聚類后各樣品中不同 OTU（不同菌屬）所含序列的豐度 作 heatmap 圖，能夠反映出在菌屬水平上各樣品菌落結(jié)構(gòu)的相似性和差異性 |
4樓2016-03-08 21:22:01
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