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WinlinuxMac新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
Material Studio怎么畫(huà)離子鍵啊 已有1人參與
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本人是初學(xué)者，需要算四甲基氯化銨，這個(gè)離子鍵怎么表示呢 就用一個(gè)N連接四甲基+Cl原子嗎(這樣在AC是兩行應(yīng)該是兩個(gè)分子吧？) 另外還有一個(gè)問(wèn)題: Discover模塊的NP(V)T過(guò)程時(shí)，status.txt中cpu time比現(xiàn)實(shí)少9小時(shí)，似乎是自己這邊斷網(wǎng)再重連或程序重啟后影響了服務(wù)器那邊的過(guò)程，聽(tīng)起來(lái)確實(shí)很傻，但就醬 |
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月只藍(lán)
主管區(qū)長(zhǎng) (職業(yè)作家)
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- 管轄: 計(jì)算模擬區(qū)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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1. MS分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算，離子鍵不需要表示出來(lái)，只是力場(chǎng)分配合適，會(huì)自動(dòng)讓四甲基銨為陽(yáng)離子、氯為陰離子形式。 2. Discover的status.txt中cpu time比現(xiàn)實(shí)慢，是因?yàn)镈iscover對(duì)CPU的利用率不高造成的；可以discover跑MD的過(guò)程中，查看CPU的使用率，單顆CPU使用率波動(dòng)很大，難以達(dá)到100%；計(jì)算時(shí)間越長(zhǎng)，status.txt中時(shí)間和現(xiàn)實(shí)差距就越大。 解決辦法：棄用Discover模塊，這個(gè)模塊在MS歷次更新中，已有被放棄的趨勢(shì)；采用功能完全覆蓋Discover的Forcite模塊，樓主可以比較一下同樣計(jì)算量，開(kāi)相同的核心數(shù)目，看Forcite比Discover快多少。 |
2樓2015-05-11 20:48:00
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