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lj900911

新蟲 (初入文壇)

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蟲號(hào): 1933131
注冊(cè): 2012-08-10
專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] gaussian 09 做剛性掃描 scan 問(wèn)題求助已有2人參與

我想做兩個(gè)分子體系的剛性掃描，如圖，掃描第6號(hào)C和50號(hào)氧的鍵長(zhǎng)�？墒窍旅孀鴺�(biāo)里沒(méi)有標(biāo)出這個(gè)鍵，請(qǐng)問(wèn)我該怎么輸入？如果按照opt=modredundant那樣的輸入，例如5 60 1.4 S 10 0.2 ，只進(jìn)行一步就結(jié)束了。求大神指教

C
H                1          B1
H                1          B2 2          A1
H                1          B3 2          A2 3          D1 0
C                1          B4 2          A3 4          D2 0
C                5          B5 1          A4 2          D3 0
H                6          B6 5          A5 1          D4 0
C                6          B7 5          A6 1          D5 0
H                8          B8 6          A7 5          D6 0
H                8          B9 6          A8 5          D7 0
C                8          B10 6          A9 5          D8 0
H                11          B11 8          A10 6          D9 0
H                11          B12 8          A11 6          D10 0
C                11          B13 8          A12 6          D11 0
H                14          B14 11          A13 8          D12 0
H                14          B15 11          A14 8          D13 0
C                5          B16 1          A15 6          D14 0
H                17          B17 5          A16 1          D15 0
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H                17          B19 5          A18 1          D17 0
C                11          B20 8          A19 6          D18 0
H                21          B21 11          A20 8          D19 0
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O                14          B24 11          A23 8          D22 0
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H                27          B29 26          A28 25          D27 0
O                26          B30 25          A29 14          D28 0
C                21          B31 11          A30 8          D29 0
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C                14          B33 11          A32 8          D31 0
H                34          B34 14          A33 11          D32 0
H                34          B35 14          A34 11          D33 0
O                5          B36 1          A35 17          D34 0
H                37          B37 5          A36 1          D35 0
C                6          B38 5          A37 1          D36 0
C                39          B39 6          A38 5          D37 0
C                40          B40 39          A39 6          D38 0
C                41          B41 40          A40 39          D39 0
C                42          B42 41          A41 40          D40 0
C                43          B43 42          A42 41          D41 0
H                40          B44 39          A43 6          D42 0
H                42          B45 41          A44 40          D43 0
H                43          B46 42          A45 41          D44 0
O                44          B47 43          A46 42          D45 0
H                48          B48 44          A47 43          D46 0
O                39          B49 6          A48 5          D47 0
C                41          B50 40          A49 39          D48 0
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H                51          B52 41          A51 40          D50 0
C                51          B53 41          A52 40          D51 0
H                54          B54 51          A53 41          D52 0
H                54          B55 51          A54 41          D53 0
O                54          B56 51          A55 41          D54 0
H                57          B57 54          A56 51          D55 0

B1          1.08256091
B2          1.08595188
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B10          1.54041887
B11          1.08923783
B12          1.08415513
B13          3.87873192
B14          1.08236822
B15          1.07949439
B16          1.52740665
B17          1.08294896
B18          1.08642398
B19          1.08499521
B20          2.54524802
B21          1.08805988
B22          1.08460282
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B30          1.19116867
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A8          110.44210890
A9          112.97321691
A10       109.20685919
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A18       109.55738775
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A20          93.51154340
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A25       111.95515151
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A28       109.83561430
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A30          33.98457646
A31       107.88865508
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A35       104.84593000
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A52       111.71725816
A53       110.14440825
A54       109.91078009
A55       108.21157359
A56       110.40234866
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D4          55.09666741
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D14       -126.15096178
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D17       -57.65799618
D18       175.27644619
D19       -108.63788162
D20          -0.76043149
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D27          58.48550235
D28          0.10133177
D29       128.10735169
D30       -117.30805075
D31       -172.07492027
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D33       -109.21886371
D34       -119.15948102
D35       161.89008705
D36       -58.73729235
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D38       -141.87075022
D39          1.99109084
D40          -5.05826317
D41          1.79057650
D42          37.84812519
D43       177.06077875
D44       -176.67800271
D45       -177.05324620
D46       151.35693380
D47          -2.95910519
D48       -176.84249319
D49       -125.60799608
D50          -7.43792189
D51       114.26376058
D52          52.40308773
D53       -66.21654010
D54       172.74188622
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1樓 2015-05-24 16:04:18

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小范范1989

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4樓: Originally posted by lj900911 at 2015-05-25 16:37:18
可是你那個(gè)帖子是柔性掃描啊~~opt=modredundant不是做柔性掃描么？scan是剛性啊~~那個(gè)S 是執(zhí)行放松的勢(shì)能面掃描不是嗎？...

對(duì)，我寫的是柔性掃描，假如說(shuō)柔性掃描的scan你都會(huì)用了，剛性掃描的scan不會(huì)用？你仔細(xì)查閱一下scan的用法。

高斯剛性掃描。只支持內(nèi)坐標(biāo)，應(yīng)該寫為：變量名，初始值，步數(shù)，步長(zhǎng)。

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lj900911

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6樓2015-05-26 08:21:41

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youyno

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2樓2015-05-24 19:18:35

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3樓2015-05-24 22:11:01

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引用回帖:

3樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-05-24 22:11:01
看看我在這個(gè)帖子的回復(fù)。
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=8756616&fpage=1

可是你那個(gè)帖子是柔性掃描啊~~opt=modredundant不是做柔性掃描么？scan是剛性啊~~那個(gè)S 是執(zhí)行放松的勢(shì)能面掃描不是嗎？

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4樓2015-05-25 16:37:18

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