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小蟲_sang鐵蟲 (正式寫手)
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[求助]
氣體在石墨烯空隙中擴(kuò)散動(dòng)力學(xué)模擬報(bào)錯(cuò)、失敗 已有1人參與
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我想模擬CH4分子在石墨烯孔道中的擴(kuò)散問題，我是這樣做的：1.構(gòu)建石墨烯孔道結(jié)構(gòu)并優(yōu)化；2.構(gòu)建一定密度的CH4氣體盒子并優(yōu)化；3.通過“Built Layers”構(gòu)建Layers結(jié)構(gòu)，并優(yōu)化；4.跑動(dòng)力學(xué)（NVT、298K、步長1fs、時(shí)間10000ps、Andersen控溫） 但是在跑到產(chǎn)不多一半的時(shí)候就報(bào)錯(cuò)，提示能量偏差超過設(shè)定值。并且能量和溫度曲線呈現(xiàn)上升趨勢(shì)（如下圖）。并且同樣的模型在其他密度下（氣體盒子中CH4密度不同）都成功計(jì)算了，只有在這個(gè)密度下的計(jì)算失敗了。".out"文件如附件所示 溫度、能量曲線.png |
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sutaolong
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4樓2015-06-11 15:10:40
pigrass
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5樓2015-06-11 15:15:42
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