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丫丫兮兮1991新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
分子間氫鍵 已有1人參與
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| 最近在算兩個(gè)分子間氫鍵的鍵能，但在優(yōu)化這兩個(gè)分子體系的時(shí)候，老是出現(xiàn)L502錯(cuò)誤，我覺(jué)得應(yīng)該是這兩個(gè)分子間的構(gòu)型擺的不對(duì)，不知道大家有沒(méi)有什么快速擺對(duì)分子構(gòu)型的方法，急求呀�。。。。。� |
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zhou2009
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
丫丫兮兮1991: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-06-18 21:03:47
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
丫丫兮兮1991: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-06-18 21:03:47
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1、首先應(yīng)該分別優(yōu)化形成氫鍵的雙方，再拼在一起算氫鍵。不要把單個(gè)優(yōu)化的問(wèn)題帶到大體系中。 2、b3lyp不能算弱相互作用，不能用來(lái)算氫鍵，但體系如此之大，要用DFT-D才有可能。DFT-D在G09 D版才有。 3、不要一開(kāi)始就想算 freq，算完opt再說(shuō)。 freq需要更大的計(jì)算量和存儲(chǔ)空間。 4、拼接時(shí)優(yōu)先考慮O。最好同時(shí)考慮多個(gè)�？梢苑謩e畫(huà)出二者的靜電勢(shì)圖幫助選擇拼接點(diǎn)。 |
丫丫兮兮199111樓2015-06-18 08:59:32
zhou2009
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2樓2015-06-16 17:44:43
kong890109
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3樓2015-06-16 22:13:19
丫丫兮兮1991
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4樓2015-06-16 22:33:42
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