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fanghongxun鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
【急】求問在服務(wù)器上，用ADF計算轉(zhuǎn)移積分的輸入文件的準備
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計算轉(zhuǎn)移積分的時候，需要準備兩個片段的 .t21文件。 問題1，在我自己的電腦（windows）上計算時，通過計算片段的單點能就可以得到該片段的 .t21文件。但是提交到服務(wù)器上之后，只能得到TAPE21, TAPE13, t21.H. t21.C. logfile, *.run.log. *.run.error，并沒有.t21文件。 問題2， 向服務(wù)器提交輸入文件時，除了提交總的輸入文件 .run文件，兩個片段分別的 .t21文件之外，還需要提供什么文件？ 片段的輸入文檔 #! /bin/sh # ============================== # The Molecule # ============================== "$ADFBIN/adf" <<eor TITLE U2u ATOMS 1 C 10.768900000000 8.628500000000 19.616300000000 2 F 13.764600000000 7.505200000000 6.669200000000 ......坐標 43 H 8.556200000000 8.359600000000 14.088800000000 44 C 11.317700000000 8.415500000000 12.504900000000 END GUIBONDS 1 40 41 1 2 42 43 1 。。。。。 49 37 38 1 50 39 40 1 51 40 42 1 END BASIS type DZP core None createoutput None END XC GGA PW91 END SAVE TAPE21 TAPE13 NOPRINT LOGFILE eor 總的輸入文檔 #! /bin/sh # dependency: {} R2u.t21 # dependency: {} R2d.t21 # ============================== # The Molecule # ============================== "$ADFBIN/adf" <<eor TITLE R2 ATOMS 1 F 17.490800000000 7.186600000000 16.057600000000 f=Region_2 b=Region_2 2 F 17.284200000000 9.283100000000 14.328800000000 f=Region_2 b=Region_2 3 F 17.767600000000 8.918600000000 11.710300000000 f=Region_2 b=Region_2 。。。。坐標 86 C 8.992000000000 8.530800000000 14.914900000000 f=Region_1 b=Region_1 87 H 8.556200000000 8.359600000000 14.088800000000 f=Region_1 b=Region_1 88 C 11.317700000000 8.415500000000 12.504900000000 f=Region_1 b=Region_1 END GUIBONDS 1 1 9 1 2 2 22 1 3 3 23 1 。。。。 99 83 84 1 100 84 86 1 101 84 85 1 102 86 87 1 END SYMMETRY NOSYM BASIS type DZP core None createoutput None END XC GGA PW91 END Fragments Region_1 R2u.t21 Region_2 R2d.t21 end SAVE TAPE21 TAPE13 NOPRINT LOGFILE TRANSFERINTEGRALS eor |
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2樓2015-06-30 09:08:25
fanghongxun
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3樓2015-06-30 09:39:02
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