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吉米愛多鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
GROMACS中,怎么樣將TIP4P水模型的參數(shù)修正,得到TIP4P/ICE的水模型? 已有1人參與
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| 附件中,tip4p.itp是gromacs軟件自帶的水分子的一種模型,param這張圖是文獻(xiàn)中不同水模型的參數(shù),F(xiàn)在我知道怎么樣修改q,epsilon和sigma參數(shù)了,而且鍵角L(H-O-H)和氧氫原子距離d(O-H)也不用修改,只需要添加一項(xiàng)d(O-M)到itp文件中應(yīng)該就可以了。但是軟件自帶的tip4p.itp中,只限制了d(O-H)和d(H-H),并未限制O-M原子間距離。那么O-M這一項(xiàng)應(yīng)該怎么添加呢? |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗(yàn): +14 |
金蟲 (小有名氣)
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