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大姚金蟲 (小有名氣)
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[求助]
Topomer CoMFA 已有1人參與
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各位老師，我是SYBYL學(xué)習(xí)新手，學(xué)習(xí)Topomer CoMFA的過程中遇到問題： 1、打開我的小分子數(shù)據(jù)集（hits格式文件）后，電腦顯示Your new dataset has no biological data. You have the choice of: -Exit and use dbtranslate to put values into a hitlist. -Load your dataset into a spreadsheet and import values and save as a hitlist.請問我要怎么為我的小分子數(shù)據(jù)集添加生物活性數(shù)據(jù)？是在網(wǎng)上的數(shù)據(jù)庫下載嗎？有無這種類型的數(shù)據(jù)庫？ 2、在文獻中列出的小分子數(shù)據(jù)集（IC50值、PIC50值等）的word文檔，怎么導(dǎo)入到sybyl中去？是手動的一個一個畫，還是集體導(dǎo)入？ PS：我用的是 SYBYL-X 2.0 萬分焦急，如若能幫助解決問題，必當重謝�。�！ |
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janzo
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2樓2016-05-07 19:09:54
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【答案】應(yīng)助回帖
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大姚: 金幣+20, ★有幫助 2016-05-11 20:54:14
月只藍: 金幣+5, 感謝應(yīng)助。 2016-05-11 20:57:29
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月只藍: 金幣+5, 感謝應(yīng)助。 2016-05-11 20:57:29
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1.生物活性來自文獻數(shù)據(jù)或者你自己的活性實驗數(shù)據(jù)啊，你任意拿來一個結(jié)構(gòu)做QSAR肯定是不可能的��； 2.生物活性數(shù)據(jù)可以自己一個一個輸入（如果數(shù)量很較少的話），或者活性數(shù)據(jù)保存為一個txt文檔，一個活性數(shù)據(jù)一行，用分子表單的import命令即可導(dǎo)入到表單中，注意化合物名稱與活性數(shù)據(jù)的對應(yīng)，當然2.0可以在txt中建立兩列，第一列為化合物名稱，第二列為活性數(shù)據(jù)，方便導(dǎo)入，不易出錯。 |
3樓2016-05-10 21:51:35
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