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guaiguaizhxd木蟲 (小有名氣)
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[求助]
Materials Studio 8.0 在Linux下SGE隊列配置求助-已解決
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集群系統(tǒng)配置：rocks 6.1 安裝了MS 8.0并且license也沒問題，顯示check out succeed。但是配置隊列的時候出了問題。 使用 configure queue SGE命令后，總是顯示 "could not detect queuingsystem dsd_sge Please check your environment! " 但是我的sge環(huán)境是沒問題的，qstat和qconf以及qsub在MS安裝用戶下都能正常用。 之前也曾嘗試安裝過 MS7.0 MS6.1。其中MS7.0的出錯信息和MS8.0一模一樣。而MS6.1的出錯信息是 ” Queue name = ??? " 多謝大家指教！！ 經(jīng)過一個下午的分析，問題已經(jīng)解決！��！ 原理是這樣：MS通過dsd_sge.pm這樣一個perl腳本去檢查SGE的版本，主要分三種情況： 1.sge 2.oge 3.uge 通過讀代碼，MS判斷的方法是，執(zhí)行sge_execd -help 命令，看返回參數(shù)來決定SGE版本。 由于Rocks使用的SGE版本是后續(xù)的open grid engine維護(hù)的，因此返回變量和上述三種都對應(yīng)不上，因此導(dǎo)致無法識別。 因此解決方法也很簡單，把dsd_sge.pm文件中的 有一處：~ /SGE (.*) \n/i 中的SGE改成GE就可以了。然后在configure配置隊列就可以了 剛測試了下castep，算了個能帶和態(tài)密度，OK。 |
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