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clareleelove銅蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
Amber如何處理琥珀酸酐修飾酶上面的lys殘基
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首先，先謝謝各位大神了。萬(wàn)分感激�。�！ 結(jié)合Gaussian和antechamber，生成了琥珀酸酐的拓?fù)浜蛥?shù)文件。我在想，按照Amber官網(wǎng)B4教程后半部分，生成琥珀酸酐和酶的體系，先能量最小化，再升溫平衡，然后用bond連接琥珀酸酐和酶上面的lys殘基，由于根據(jù)實(shí)驗(yàn)有四個(gè)lys殘基發(fā)生反應(yīng)，所以我打算重復(fù)上述步驟，將4個(gè)lys殘基與琥珀酸酐反應(yīng)，這樣是否可行？ |
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2樓2015-08-03 15:49:24
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