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bbemajj828

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[求助] lammps并行版安裝問(wèn)題！cannot find -lfftw是個(gè)什么鬼？求教大神... 我快要哭死了... 已有4人參與

昨天和今天折騰了兩天，試著安裝lammps的并行版，按照網(wǎng)上的好幾個(gè)教程都走了一遍，每次都是到最后一步make g++的時(shí)候出問(wèn)題。請(qǐng)教大神，這個(gè)問(wèn)題該怎么弄？
/usr/bin/ld: cannot find -lfftw
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[1]: *** [../lmp_g++] Error 1
make[1]: Leaving directory `/mnt/lammps-30Sep13/src/Obj_g++'
make: *** [g++] Error 2

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1樓 2015-08-04 13:55:47

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gqs8822837

銅蟲 (小有名氣)

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【答案】應(yīng)助回帖

1. 安裝fftw3:
(1) 去fftw官網(wǎng)下載最新的tarball (e.g. fftw-3.3.8.tar.gz)
(2) 解壓fftw的tarball (e.g. sudo tar -xzvf fftw-3.3.8.tar.gz)
(3) 進(jìn)入已解壓后的文件夾進(jìn)行配置: "./configure --prefix=XXX --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes", 其中的XXX就是你想要安裝fftw3的路徑，我沒(méi)有選擇默認(rèn)的路徑，而是先在/home/<我的用戶名>/下創(chuàng)建了一個(gè)mysoft的文件夾，在mysoft里面又創(chuàng)建了一個(gè)fftw3的文件夾，所以我的配置是"./configure --prefix=/home/<我的用戶名>/mysoft/fftw3 --enable-float --enable-mpi --enable-shared=yes"
(4) sudo make -j 8
(5) sudo make install
(6) 進(jìn)入/home/<我的用戶名>/mysoft/fftw3中查看是不是產(chǎn)生了bin include lib share文件夾

2. 安裝OpenMPI:
(1) 去OpenMPI官網(wǎng)下載最新的tarball (e.g. openmpi-3.1.2.tar.gz)
(2) 解壓OpenMPI的tarball (e.g. sudo tar -xzvf openmpi-3.1.2.tar.gz)
(3) 進(jìn)入已解壓后的文件夾進(jìn)行配置: "./configure --prefix=/home/<我的用戶名>/mysoft/openmpi", 跟剛才一樣，先在mysoft中創(chuàng)建好openmpi文件夾
(4) sudo make -j 8
(5) sudo make install
(6) 進(jìn)入/home/<我的用戶名>/mysoft/openmpi中查看是不是產(chǎn)生了bin include lib文件夾

3. 安裝lammps:
(1) 用git下載lammps: sudo git clone -b stable https://github.com/lammps/lammps.git /home/<我的用戶名>/mysoft/lammps
(2) 進(jìn)入lammps/src中，sudo make package-status，sudo make yes-<package name>
(3) 進(jìn)入lammps/src/STUBS中，sudo make
(4) 從/src/MAKE/MACHINES中拷貝Makefile.ubuntu:
sudo cp /home/<我的用戶名>/mysoft/lammps/src/MAKE/MACHINES/Makefile.ubuntu /home/<我的用戶名>/mysoft/lammps/src/MAKE/
(5) 修改MAKE文件: sudo vim /home/<我的用戶名>/mysoft/lammps/src/MAKE/Makefile.ubuntu，對(duì)照下面內(nèi)容進(jìn)行更改,
"FFT_INC =    -DFFT_FFTW3 -I/home/<我的用戶名>/mysoft/fftw3/include "
"FFT_PATH =    -L/home/<我的用戶名>/mysoft/fftw3/lib                "
"FFT_LIB =    -lfftw3                         "

"MPI_INC =    -DMPICH_SKIP_MPICXX -DOMPI_SKIP_MPICXX=1 -I/home/<我的用戶名>/mysoft/openmpi/include"
"MPI_PATH = -L/home/<我的用戶名>/mysoft/openmpi/lib"
"MPI_LIB = -lmpi -lmpi_cxx"
(6) 回到lammps/src文件夾中，sudo make -j8 ubuntu

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8樓2018-09-20 09:39:10

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

找不到fftw庫(kù)文件，需要指定fftw庫(kù)的路徑

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2樓2015-08-04 22:13:01

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甲子

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

需要先安裝fft包

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3樓2015-08-05 15:03:06

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2樓: Originally posted by 0xiaobao at 2015-08-04 22:13:01
找不到fftw庫(kù)文件，需要指定fftw庫(kù)的路徑

你好，謝謝你的回復(fù)，我追問(wèn)一下，我在安裝lammps之前已經(jīng)安裝好了fftw文件呀，那么這個(gè)fftw的庫(kù)的路徑應(yīng)該在哪里指定呢？

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4樓2015-08-13 21:50:46

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3樓: Originally posted by 甲子 at 2015-08-05 15:03:06
需要先安裝fft包

謝謝你的回復(fù)，問(wèn)題是我已經(jīng)提前安裝了fftw包，現(xiàn)在提示找不到，我也不知道在哪里指定路徑呢~這里不是提示說(shuō)/usr/bin/ld: cannot find -lfftw嗎？也就是說(shuō)在/usr/bin/ld路徑下找不到fftw庫(kù)，那么你們安裝完fftw后在這個(gè)路徑下有這個(gè)庫(kù)嗎？

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5樓2015-08-13 21:52:10

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alundilong

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引用回帖:

5樓: Originally posted by bbemajj828 at 2015-08-13 07:52:10
謝謝你的回復(fù)，問(wèn)題是我已經(jīng)提前安裝了fftw包，現(xiàn)在提示找不到，我也不知道在哪里指定路徑呢~這里不是提示說(shuō)/usr/bin/ld: cannot find -lfftw嗎？也就是說(shuō)在/usr/bin/ld路徑下找不到fftw庫(kù)，那么你們安裝完fftw后在 ...

打開src/MAKE/Makefile.g++
在其中找到關(guān)鍵字FFT_INC 和 FFT_LIB
在FFT_INC中給你fftw的頭文件路徑，比如
FFT_INC = -I YOUR/PATH/TO/FFTW/INCLUDE
在FFT_LIB 中添加fftw的庫(kù)路徑，比如
FFT_INC = -L YOUR/PATH/TO/FFTW/LIBRARY

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6樓2015-08-13 23:46:52

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sbkk

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6樓: Originally posted by alundilong at 2015-08-13 23:46:52
打開src/MAKE/Makefile.g++
在其中找到關(guān)鍵字FFT_INC 和 FFT_LIB
在FFT_INC中給你fftw的頭文件路徑，比如
FFT_INC = -I YOUR/PATH/TO/FFTW/INCLUDE
在FFT_LIB 中添加fftw的庫(kù)路徑，比如
FFT_INC = -L YOUR/PA ...

您好，在這篇介紹安裝lammps
2018版lammps安裝教程（小白專用）
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=12313102&target=1
這里面直接在usr/local安裝fftw和mpich，結(jié)果按照這篇帖子里面寫的內(nèi)容

/lammps/src/MAKE/MACHINES文件下將Makefile.ubuntu剪切到/lammps/src/MAKE文件夾下

sudo make ubuntu j4

編譯失敗

/usr/bin/x86_64-linux-gnu-ld: cannot find -lfftw3
collect2: error: ld returned 1 exit status
Makefile:93: recipe for target '../lmp_ubuntu' failed
make[1]: *** [../lmp_ubuntu] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/xxx/lammps/src/Obj_ubuntu'
Makefile:175: recipe for target 'ubuntu' failed
make: *** [ubuntu] Error 2

怎么辦？？是修改路徑么？

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路能走多遠(yuǎn)，在于事先準(zhǔn)備的有多好。不要看到希望而堅(jiān)持，只有堅(jiān)持才會(huì)看到希望。

7樓2018-09-19 23:14:52

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引用回帖:

8樓: Originally posted by gqs8822837 at 2018-09-20 09:39:10
1. 安裝fftw3:
(1) 去fftw官網(wǎng)下載最新的tarball (e.g. fftw-3.3.8.tar.gz)
(2) 解壓fftw的tarball (e.g. sudo tar -xzvf fftw-3.3.8.tar.gz)
(3) 進(jìn)入已解壓后的文件夾進(jìn)行配置: "./configure --pre ...

您好，按照您的方法執(zhí)行到最后一步報(bào)錯(cuò)

~/mysoft/lammps/src$ sudo make ubuntu -j8

make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src'
make[1]: 'lmpinstalledpkgs.h' is up to date.
make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src'
Compiling LAMMPS for machine ubuntu
make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu'
../../lib/quip/Makefile.lammps:17: *** Environment or make variable QUIP_ROOT must be set.. Stop.
make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu'
make[1]: Entering directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu'
../../lib/quip/Makefile.lammps:17: *** Environment or make variable QUIP_ROOT must be set.. Stop.
make[1]: Leaving directory '/home/bit538/mysoft/lammps/src/Obj_ubuntu'
Makefile:175: recipe for target 'ubuntu' failed
make: *** [ubuntu] Error 2

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路能走多遠(yuǎn)，在于事先準(zhǔn)備的有多好。不要看到希望而堅(jiān)持，只有堅(jiān)持才會(huì)看到希望。

9樓2018-09-21 16:11:10

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yichangli

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7樓: Originally posted by sbkk at 2018-09-19 23:14:52
您好，在這篇介紹安裝lammps
2018版lammps安裝教程（小白專用）
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=12313102&target=1
這里面直接在usr/local安裝fftw和mpich，結(jié)果按照這篇帖子里面寫的內(nèi)容
...

你好，是在 /lammps/src 目錄下輸入 sudo make mpi -j4 哦

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工科研究生，工程熱物理

10樓2018-10-04 00:46:09

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