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guofeng17新蟲 (初入文壇)
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[求助]
vmd生成psf文件
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我是namd的新手,剛看完namd的教程,想做一個蛋白質(zhì)與單晶硅的相互作用練習一下。現(xiàn)在寫完單晶硅的坐標文件了,隨便找了一個蛋白質(zhì)分子,把他們放到一起,保存成了pdb文件,但是現(xiàn)在生成psf文件遇到了問題。按照教程寫的一直有錯誤。我查了一下,好像是拓撲文件的問題,文件沒有硅的結(jié)構(gòu)信息。我剛剛接觸不太了解,想請教一下,像這種自己寫的分子psf怎么生成?拓撲文件只能自己去寫嗎,可不可以在網(wǎng)上下載到? 謝謝了!! temp是我上傳了生成的pdb文件 我只有一個b。。。。。。不好意思 求通過 |
新蟲 (初入文壇)

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