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shiling1813新蟲 (小有名氣)
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[求助]
CO2分子的構(gòu)形不再是直線型的原因？ 已有1人參與
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大家好。最近我使用forcite進行50個CO2分子動力學(xué)計算時，發(fā)現(xiàn)有些CO2分子的構(gòu)形不再是直線型的，鍵角之間的夾角不再是180度，我現(xiàn)在有些困惑啊，不知道是勢函數(shù)（我用的是compass勢）的問題，還是其它的問題？ 我在進行分子動力學(xué)計算之前。先使用Dmol3模塊對一個CO2分子進行了結(jié)構(gòu)優(yōu)化，優(yōu)化完后CO2分子還是直線型的，然后復(fù)制了50個CO2進行分子動力學(xué)NVT系綜計算，發(fā)現(xiàn)有些CO2分子的構(gòu)形不再是直線型的。 請前輩高人指點！ |
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月只藍
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
shiling1813: 金幣+20, ★★★很有幫助 2015-08-10 21:09:59
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單個CO2是直線型，多個CO2中的單個CO2就不一定是直線型，因為CO2還要受其他原子作用。 對于單個CO2而言，如果其他原子對其有作用力，O-C-O鍵角改變是很正常的事情。 COMPASS和Dmol3模塊，分別是分子力學(xué)和量子力學(xué)的方法，如果兩者分別對單個CO2幾何優(yōu)化后，鍵角不一致也是很正常的事情。 |
2樓2015-08-09 18:56:31
shiling1813
新蟲 (小有名氣)
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3樓2015-08-10 21:09:54
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