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fanc232新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求推薦計(jì)算HOMO-LUMO gap的教程 已有2人參與
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大家好，我是學(xué)生物的，現(xiàn)在研究藥物小分子-蛋白質(zhì)大分子之間相互作用。 查文獻(xiàn)說(shuō)計(jì)算HOMO-LUMO之間的gap，可以幫助預(yù)測(cè)藥物分子-蛋白質(zhì)作用強(qiáng)度。 因此在這里求大家給推薦個(gè)這方面的教程，我自己沒(méi)找到。 謝謝大家！ 另外多問(wèn)個(gè)問(wèn)題，小分子上的某個(gè)原子，受到外界各種電子相互作用影響以后，這個(gè)原子上電子云的密度可以定量計(jì)算嗎？ |
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ztl19780124
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4樓2015-08-12 11:10:17
zhou2009
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fanc232: 金幣+30, ★有幫助, 版主完全地回答了我兩個(gè)問(wèn)題，回答又特別及時(shí)！引導(dǎo)性很強(qiáng)！ 2015-08-16 09:33:14
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HOMO、LUMO是每次計(jì)算都會(huì)自動(dòng)輸出的內(nèi)容。加關(guān)鍵詞pop=full可以輸出詳細(xì)的MO信息。在GV中可以看到HOMO、LUMO的能級(jí)和形象。 原子上電子云的密度可以定量計(jì)算出來(lái)，電荷的前后變化量也可以定量計(jì)算出來(lái)。 |
2樓2015-08-10 11:22:56
chu5263821
銅蟲(chóng) (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
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fanc232: 金幣+20, ★有幫助, 我畢竟還沒(méi)入量化軟件的門兒，所以這位同學(xué)的回答對(duì)我來(lái)說(shuō)，很詳細(xì)，幫助很大！ 2015-08-16 09:34:16
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| 在opt優(yōu)化結(jié)果中尋找occ和virt的數(shù)值，occ最后一個(gè)值就是HOMO，virt第一個(gè)值就是LUMO，LUMO-HOMO之差叫能隙差，其值越大，表明分子越穩(wěn)定，其值越小，表明分子越活潑 |
3樓2015-08-12 06:41:57
xamiracle407
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5樓2015-12-29 23:16:51
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