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發(fā)現(xiàn)微妙新蟲 (初入文壇)
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[求助]
【求助求助】分子小白請教測序和序列有效性方面的問題~~ 已有3人參與
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背景：本人專業(yè)生態(tài)學(xué)，半路被導(dǎo)師拉來做分子。課題主要內(nèi)容是，通過獲得一個未知物種的保守序列（CO1）來鑒定該物種。 問題：CO1基因在進(jìn)化中相對保守，可以用來物種分類和鑒定。我用上下游引物分別得到一段序列（650bp），然后拼接成一段700bp左右的拼接序列。 問題來了~~~測序結(jié)果經(jīng)常會出現(xiàn)兩條序列前幾十個堿基雙峰。 1、現(xiàn)在物種和兩條引物已知，怎樣獲得該物種兩端確定、堿基數(shù)確定的CO1基因序列？ 2、上下游引物是在CO1基因外兩側(cè)進(jìn)行結(jié)合么？如何判斷CO1基因兩端不在出現(xiàn)雙峰的前幾十個堿基里？ 3、如果不在的話，這樣的拼接序列可以用于學(xué)術(shù)論文發(fā)表么？ |
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junfeng0202
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