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daixing2011銅蟲 (初入文壇)
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Dmol3優(yōu)化周期結(jié)構(gòu)，如何實現(xiàn)離域內(nèi)坐標(biāo)？
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看MS說明書，以及網(wǎng)上的討論，Dmol3用離域內(nèi)坐標(biāo)優(yōu)化(delocalized internal coordinate)，效率超級快。 但手冊上的例子，只是在MS面板上設(shè)置任務(wù)等等，并沒有體現(xiàn)出哪里設(shè)置了離域內(nèi)坐標(biāo)。 測試了幾個手冊中的關(guān)鍵詞，如Opt_Del_Test, Opt_Bend_Lin,也都無效，程序提示輸入錯誤。 請問，Dmol在周期性優(yōu)化中怎樣實現(xiàn)離域內(nèi)坐標(biāo)，還是默認(rèn)就已經(jīng)是了？不像吧，輸出文件中都是笛卡爾坐標(biāo)。 另外，做表面吸附的研究，物理吸附，適合用離域內(nèi)坐標(biāo)么。 Thanks in advance |
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3樓2015-08-15 01:41:46
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4樓2015-08-15 01:46:08
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感謝您再次回復(fù)。 您指的“掃描”，是否是逐個做單點能，比如X=Y=10，X=Y=10.5，.....，這樣，然后要一個能量最低的？ dmol3優(yōu)化一個周期表面，我這里一直都出現(xiàn)這樣的情況： opt== Cycle Total Energy Energy change Max Gradient Max Displacement opt== tolerance:....... 0.0000100 0.001058 0.009449 opt== 1 -32105.2859592 0.0000000 0.000066 0.000089 Step 1 <-- DELOC <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | Parameter | value | tolerance | units | OK? | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC | delta E | -0.204437E+02 | 0.100000E-04 | Ha | No | <-- DELOC | |F|max | 0.660822E-04 | 0.105835E-02 | au | Yes | <-- DELOC | |dR|max | 0.889212E-04 | 0.944863E-02 | au | Yes | <-- DELOC +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- DELOC Geometry optimization completed successfully in 1 steps. 然后就正常結(jié)束了。 很奇怪，delta E 并沒有收斂，這是不是幾何結(jié)構(gòu)收斂了但晶格沒有收斂？為什么還能正常結(jié)束呢。 請指點，多謝。 |
5樓2015-08-15 20:31:43
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6樓2015-08-15 21:14:41
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