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zym765319199金蟲 (小有名氣)
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[求助]
position restrain
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求大神指點，如何用backbone 做position restrain 我的思路：先用VMD輸出一個蛋白的backbone的pdb文件，用pdb2gmx指令生成gro文件，top文件，porse.itp文件，然后把porse.itp download,并且刪除生成的文件，upload完整的蛋白的pdb文件，用pdb2gmx生成完整蛋白的gro文件。top文件，porse.itp文件，把porse.itp刪掉，上傳 剛剛download的porse. itp 文件，然后開始做一般的過程。 但是，抱錯了！錯誤顯示為組氨酸沒有完整的環(huán)！但是組氨酸的環(huán)在側(cè)鏈上，不知道什么原因？求大神指點 |
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