 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2634 | 回復(fù): 7 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
小_書_蟲_鐵蟲 (初入文壇)
|
[求助]
pdb2gmx找不到rtp力場文件 已有1人參與
|
||
哪位大神幫忙看下為何找不到rtp文件啊，都放在一個(gè)目錄里了 目錄.JPG 錯(cuò)誤提示.JPG |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
考研調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
281求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0805 316求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085601求調(diào)劑總分293英一數(shù)二
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
08工學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有17人回復(fù)
-
340求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
食品專碩 一志愿雙一流 328
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
300分，材料，求調(diào)劑，英一數(shù)二
已經(jīng)有5人回復(fù)
小_書_蟲_
鐵蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 54.5
- 帖子: 27
- 在線: 12.7小時(shí)
- 蟲號: 4016298
- 注冊: 2015-08-11
- 專業(yè): 其他無機(jī)非金屬材料
3樓2015-08-21 09:09:57
fangsteel
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 96 (初中生)
- 金幣: 1213.6
- 散金: 32
- 紅花: 22
- 帖子: 456
- 在線: 192.1小時(shí)
- 蟲號: 2248690
- 注冊: 2013-01-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 原子和分子物理
2樓2015-08-20 18:28:02
小_書_蟲_
鐵蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 54.5
- 帖子: 27
- 在線: 12.7小時(shí)
- 蟲號: 4016298
- 注冊: 2015-08-11
- 專業(yè): 其他無機(jī)非金屬材料
|
這是rtp文件，pdb文件是一個(gè)鏈長為50的PVC（聚氯乙烯）。 [ bondedtypes ] ; Column 1 : default bondtype ; Column 2 : default angletype ; Column 3 : default proper dihedraltype ; Column 4 : default improper dihedraltype ; Column 5 : This controls the generation of dihedrals from the bonding. ; Column 6 : number of neighbors to exclude from non-bonded interactions ; Column 7 : 1 = generate 1,4 interactions between pairs of hydrogen atoms ; 0 = do not generate such ; Column 8 : 1 = remove proper dihedrals if found centered on the same ; bond as an improper dihedral ; 0 = do not generate such ; bonds angles dihedrals impropers all_dihedrals nrexcl HH14 RemoveDih 1 2 1 2 0 1 0 1 [ PLAS ] [ atoms ] ; name type charge chargegroup Q1 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANE Q2 opls_151 ;CL in alkyl chlorides Q3 opls_152 ;RCH2CL in alkyl chlorides Q4 opls_153 ;H in RCH2CL in alkyl chlorides Q5 opls_68 ;CH3 (C2) N-ALKANES [ bonds ] ; atom1 atom2 Q1 Q3 Q3 Q4 Q3 Q2 Q6 Q1 [ angles ] ; atom1 atom2 atom3 th0 cth [ dihedrals ] ; atom1 atom2 atom3 atom4 phi0 cp mult [ impropers ] ; atom1 atom2 atom3 atom4 q0 cq [ PVC ] ;p [ atoms ] ; name type charge chargegroup Q1 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANE Q2 opls_151 ;CL in alkyl chlorides Q3 opls_152 ;RCH2CL in alkyl chlorides Q4 opls_153 ;H in RCH2CL in alkyl chlorides Q5 opls_68 ;CH3 (C2) N-ALKANES [ bonds ] ; atom1 atom2 Q1 Q3 Q3 Q4 Q3 Q2 [ angles ] ; atom1 atom2 atom3 th0 cth [ dihedrals ] ; atom1 atom2 atom3 atom4 phi0 cp mult [ impropers ] ; atom1 atom2 atom3 atom4 q0 cq [ PLAS ] [ atoms ] Q6 opls_68 ;CH3 (C2) N-ALKANES Q7 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q8 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q9 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q10 opls_73 ;CH (SP3) ISOBUTANE Q11 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q12 opls_68 ;N-ALKANES Q13 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q14 opls_467 ;AA-OR:ester Q15 opls_465 ;AA C:esters - for R on C=O, use #280-#282 Q16 opls_466 ;AA=O:esters Q17 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q18 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q19 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q20 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q21 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q22 opls_75 ;CH (AROM) BENZENOID united atom Q23 opls_465 ;AA C:esters - for R on C=O, use #280-#282 Q24 opls_466 ;AA=O:esters Q25 opls_467 ;AA-OR:ester Q26 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q27 opls_73 ;CH (SP3) ISOBUTANE Q28 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q29 opls_68 ;N-ALKANES Q30 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q31 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q32 opls_71 ;CH2 (SP3) ALKANES Q33 opls_68 ;N-ALKANES [ bonds ] Q6 Q7 Q7 Q8 Q8 Q9 Q9 Q10 Q10 Q11 Q11 Q12 Q10 Q13 Q13 Q14 Q14 Q15 Q15 Q16 Q15 Q17 Q17 Q18 Q18 Q19 Q19 Q20 Q20 Q21 Q21 Q22 Q21 Q23 Q23 Q24 Q23 Q25 Q25 Q26 Q26 Q27 Q27 Q28 Q28 Q29 Q27 Q30 Q30 Q31 Q31 Q32 Q32 Q33 [ angles ] ; atom1 atom2 atom3 th0 cth [ dihedrals ] ; atom1 atom2 atom3 atom4 phi0 cp mult [ impropers ] |
4樓2015-08-21 09:15:14
jerkwin
專家顧問 (正式寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +14 - 應(yīng)助: 454 (碩士)
- 金幣: 20699.1
- 散金: 148
- 紅花: 81
- 帖子: 813
- 在線: 2648.3小時(shí)
- 蟲號: 1023452
- 注冊: 2010-05-19
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
- 管轄: 分子模擬
5樓2015-08-21 20:57:42
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0805 316求調(diào)劑 +6 | 大雪深藏 2026-03-18 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 340求調(diào)劑 +4 | 話梅糖111 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856材料專碩353求調(diào)劑 +6 | NIFFFfff 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +4 | 13853210211 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)求調(diào)劑 +9 | 苑豆豆 2026-03-20 | 9/450 |
|
|
|
[考研]
材料學(xué)碩，求調(diào)劑
 6+3
|
糖葫蘆888ll 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 鵝鵝鵝額額額額?/a> 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 【雙一流院校新能源、環(huán)境材料，材料加工與模擬招收大量調(diào)劑】 +4 | Higraduate 2026-03-22 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿山東大學(xué)藥學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +3 | 開開心心沒煩惱 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +4 | 元夕元 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 350求調(diào)劑 +6 | weudhdk 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 尋找調(diào)劑 +4 | 倔強(qiáng)芒? 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +5 | 安憶靈 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 354求調(diào)劑 +7 | Tyoumou 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 要好好無聊 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿深大，0703化學(xué)，總分302，求調(diào)劑 +4 | 七月-七七 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 余意卿 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | shxchem 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，求調(diào)劑 +5 | 材化逐夢人 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)，327分，材料與化工085600 +9 | Ncdx123456 2026-03-19 | 9/450 |
|