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小貓的日月銅蟲 (初入文壇)
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[交流]
半定量PCR數(shù)據(jù)求統(tǒng)計分析方法
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| 各位大神，我的PCR做完了，但是不知道數(shù)據(jù)怎么分析，因為我做的是三種樣本，其中兩個是患者的病變部位組織和他本人沒有病變部位組織，這兩個是配對的，例數(shù)是一樣的；第三個是其他正常人的正常對照組織，例數(shù)和患者的例數(shù)是不一樣的。做完P(guān)CR后，我分別用三個副孔的Ct值求平均后再計算△Ct值，然后用患者病變部位的△Ct值減去沒有病變部位的△Ct值，是等于△△Ct，再求-△△Ct，之后用2^-△△Ct，求出Fold change。其中，△Ct病變組合△Ct沒有病變組可以用統(tǒng)計方法計算兩者的關(guān)系，fold change 是用來做圖的？是這樣的嗎？然后我想問下，我三個樣本用什么方法進行統(tǒng)計分析，先是三組樣本之間進行比較，再兩兩進行比較？現(xiàn)在很疑惑，謝謝！ |
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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2樓2016-05-25 21:15:56
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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| 雖然熒光定量PCR和半定量RT-PCR都可以用來檢測基因的表達(dá)量的,但二者檢測的東西多少有些不同.熒光定量PCR是在PCR反應(yīng)體系中加入可以和雙鏈DNA特異性結(jié)合的熒光染料或者和目的DNA片段結(jié)合的熒光探針，通過監(jiān)控PCR過程中熒光的變化,并且和某些管家基因的熒光變化進行對比反應(yīng)出目標(biāo)基因的表達(dá)量.我們所用的BIOG熒光定量PCR法的主要有效數(shù)據(jù)是熒光信號增長到最大值的一半時的時間.半定量RT-PCR則是通過RT-PCR最終產(chǎn)物電泳后電泳條帶的明暗來間接反應(yīng)出原始模板的豐度.我覺得樓主可以換熒光定量PCR試試 |
3樓2019-03-27 09:03:36
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