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reachsea木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
小木蟲(chóng)末席科學(xué)家
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[求助]
請(qǐng)問(wèn)grace安裝及.xvg文件作圖的問(wèn)題
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用 g_traj_mpi -f md.trr -s md.tpr -ox corr.xvg ，顯示 Select a group: 1 Selected 1: 'Protein' trn version: GMX_trn_file (single precision) Last frame 100 time 100.000 gcq#345: "Everything's formed from particles" (Van der Graaf Generator) 生成的corr.xvg（見(jiàn)附件）內(nèi)容如下： # This file was created Sat Aug 22 17:34:17 2015 # by the following command: # g_traj_mpi -f md.trr -s md.tpr -ox corr.xvg # # g_traj_mpi is part of G R O M A C S: # # Green Red Orange Magenta Azure Cyan Skyblue # @ title "Coordinate" @ xaxis label "Time (ps)" @ yaxis label "Coordinate (nm)" @TYPE xy @ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85 @ legend on @ legend box on @ legend loctype view @ legend 0.78, 0.8 @ legend length 2 @ s0 legend "atom 1 X" @ s1 legend "atom 1 Y" @ s2 legend "atom 1 Z" @ s3 legend "atom 2 X" @ s4 legend "atom 2 Y" @ s5 legend "atom 2 Z" 。。。。 0 2.2841 3.21919 1.57952 2.2889 3.31829 1.592 2.37148 3.18791 1.54231 2.21011 3.1936 1.51731 2.27042 3.153 1.71007 2.13451 3.18482 1.77272 2.0032 3.07659 1.70539 2.2957 3.00222 1.70407 2.313 2.956 1.59141 2.2972 2.94273 1.82302 2.32409 2.99168 1.90597 2.29341 2.79686 1.84081 2.38679 2.75272 1.95369 2.52623 2.81339 1.93684 2.3862 2.60008 1.9642 2.61447 2.78591 2.05877 2.14469 2.76732 1.86134 2.07971 2.80809 1.95748 2.09431 2.69239 1.76368 2.14677 2.66791 1.68214 1.95498 2.64739 1.75069 1.9121 2.658 1.60421 1.9399 2.50206 1.7961 1.83622 2.46111 1.84809 2.03637 2.4172 1.76172 2.11951 2.4482 1.7156 2.03482 2.27313 1.79085 。。。。 想做出這個(gè)坐標(biāo)文件表示的構(gòu)型圖，到網(wǎng)上查.xvg文件用什么軟件讀，說(shuō)可以用grace, 于是上 http://plasma-gate.weizmann.ac.il/Grace/doc/UsersGuide.html 下載了grace-5.1.22.tar 并按照這個(gè)網(wǎng)頁(yè)上的提示在linux下安裝，沒(méi)有成功。make tests過(guò)不了。 不知道如何安裝？ ./configure -h 看了幫助信息，仍不知道怎么設(shè)置好。 例如 ./configure --enable-grace-home=/opt/grace --with-extra-incpath=/usr/local/include:/opt/include --with-extra-ldpath=/usr/local/lib:/opt/lib --prefix=/usr 這句的選項(xiàng)都是什么意思？ 我是登陸了一個(gè)機(jī)器，想著我自己的賬戶下安裝。我自己的目錄有一個(gè)/local 目錄。 我是想建一個(gè)grace-5.1.22/目錄，將grace安裝在這個(gè)目錄下。 不知道如何編譯？ 如果安裝成功后，應(yīng)該怎么設(shè)置環(huán)境變量？ 由于對(duì)linux不懂，所以糊涂中，請(qǐng)大俠賜教！非常感謝！ |
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2015-08-22 17:42:53, 799.28 K
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