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AnaSequence金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
16s 序列用MEGA做進(jìn)化樹(shù)分析遇到問(wèn)題 已有1人參與
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| 從NCBI下載了298條 FASTA格式的16s序列，跟自己測(cè)序拼接的16S序列合并，用ClustalX進(jìn)行比對(duì)，然后用MEGA進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析，結(jié)果在進(jìn)化樹(shù)上前后相近的序列都不是BLAST找到的最相似序列對(duì)應(yīng)的種屬，BLAST出來(lái)也有一條排在比較上面的序列在進(jìn)化樹(shù)中，跟目的序列不在一個(gè)分支。遇到這種情況，一般要怎么處理？我對(duì)MEGA不算熟練。 |
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jiqinger
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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2樓2015-08-26 13:16:27
AnaSequence
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3樓2015-08-26 13:40:28
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