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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » LAMMPS/DL_POLY » 求指導？
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[求助]
求指導？ 已有1人參與
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我是這樣編寫的：compute 1 all rdf 25 2 1 fix 5 all ave/time 10 1 10 c_1 file temp.profile mode vector 25是不是代表要求的rdf的原子數？ 那2,1，分別代表什么啊： # Row c_1[1] c_1[2] c_1[3] 180 25 1 0.2 0 0 2 0.6 0 0 3 1 0 0 4 1.4 100.22 1.61538 5 1.8 20.263 2.15385 6 2.2 11.6425 2.61538 7 2.6 0 2.61538 8 3 19.8519 4.07692 9 3.4 45.5683 8.38462 10 3.8 11.7284 9.76923 11 4.2 18.6713 12.4615 12 4.6 8.89558 14 13 5 18.8249 17.8462 14 5.4 7.10183 19.5385 15 5.8 12.3128 22.9231 16 6.2 2.93887 23.8462 17 6.6 0.864515 24.1538 18 7 0.768562 24.4615 19 7.4 0 24.4615 20 7.8 0 24.4615 21 8.2 0 24.4615 22 8.6 0 24.4615 23 9 0 24.4615 24 9.4 0 24.4615 25 9.8 0 24.4615 190 25 1 0.2 0 0 2 0.6 0 0 3 1 0 0 4 1.4 0 0 5 1.8 0 0 6 2.2 0 0 7 2.6 0 0 8 3 0 0 9 3.4 0 0 10 3.8 0 0 11 4.2 0 0 12 4.6 0 0 13 5 0 0 14 5.4 0 0 15 5.8 0 0 16 6.2 0 0 17 6.6 0 0 18 7 0 0 19 7.4 0 0 : 這是我得到的結果，c-1（2，3)分別代表什么呢？ 為什么到時間190的時候c-1（2，3)的數據全部都是0啊！ |
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4樓2015-08-28 09:46:47
alundilong
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數 +1
453695608: 金幣+5, ★★★很有幫助 2015-08-28 09:44:40
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453695608: 金幣+5, ★★★很有幫助 2015-08-28 09:44:40
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手冊是這么寫的： compute ID group-ID rdf Nbin itype1 jtype1 itype2 jtype2 ... ID, group-ID are documented in compute command rdf = style name of this compute command Nbin = number of RDF bins itypeN = central atom type for Nth RDF histogram (see asterisk form below) jtypeN = distribution atom type for Nth RDF histogram (see asterisk form below) 所以25代表所分bin的數目； 2 代表中心原子的類型，在你的情況下，你選擇了type 2為中心原子 1 代表所關系的圍繞中心原子的類型，在你的情況下，你選擇了type 1 總之，你的gr畫出的是 圍繞“類型2”的 “類型為1的原子”的分布。 建議樓主：先看一下gr的定義 |
2樓2015-08-28 06:50:54
3樓2015-08-28 09:44:18
alundilong
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5樓2015-08-28 22:28:52
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