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linglanyuyi

新蟲 (初入文壇)

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[求助] 測序已知lncRNA位置，如何知道序列？已有2人參與

跟公司做了lncRNA測序，奈何分析時(shí)間早就過了，公司不給序列，求助各位大神指點(diǎn)迷津。如何在已知lncRNA位置的情況下，查詢序列？
lincRNA:chr1:134867906-134885481_f
跪求大神賜教！

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289求調(diào)劑已經(jīng)有3人回復(fù)

1樓 2015-09-08 15:46:17

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weiyf11

新蟲 (初入文壇)

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

UCSC網(wǎng)站上可以做這個(gè)事情，有序列文件可以下載

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2樓2015-09-08 16:58:18

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BioChen

銀蟲 (正式寫手)

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【答案】應(yīng)助回帖

樓上說的對，UCSC Genome Browser或許能給你點(diǎn)幫助，最好你還知道基因組版本信息（所用的參考基因組不一樣序列會(huì)有點(diǎn)差異，人最新的是hg38，也有用hg19的）。
你這條序列17k，應(yīng)該還要有外顯子信息吧。做lincRNA研究呢，還是找個(gè)懂生物信息的合作為好�。�！

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3樓2015-09-15 22:59:55

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