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有單獨(dú)安裝過(guò)bigdft的嗎
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初學(xué)bigdft。在八核單機(jī)上安裝，bigdft+opencl+openmpi 用的configure是 FC=ifort ./configure --with-ext-linalg="-lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide -lmkl_intel_thread -lmkl_core" --with-ext-linalg-path="-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64" --enable-opencl --with-ocl-path=/usr/local/cuda-6.5 --prefix=/opt/bigdft-openmpi --enable-mpi --with-mpi-prefix="/opt/openmpi-ifort-2013/" 安裝完之后運(yùn)行g(shù)pu有明顯加速，但是openmpi就沒(méi)有起到并行作用。用20個(gè)原子做的測(cè)試，單核和多核時(shí)間上沒(méi)啥變化，多核計(jì)算時(shí)結(jié)果也出現(xiàn)很多遍，有點(diǎn)像VASP并行不成功的時(shí)候。請(qǐng)問(wèn)這個(gè)問(wèn)題該怎么解決？另外bigdft似乎很占內(nèi)存，算60個(gè)原子16G內(nèi)存差不多就滿了。有類似經(jīng)歷的嗎？ |
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3樓2016-11-10 04:46:18
2樓2015-09-16 12:09:21
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