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tiani_tan金蟲 (小有名氣)
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[求助]
SSR多態(tài)性 片段大小范圍 已有1人參與
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| 請教一個問題：SSR引物篩選多態(tài)性，跑膠時對于PCR產(chǎn)物大小有沒有限制？導師只要多態(tài)性在100-300bp范圍內(nèi)？這個是什么依據(jù)？ |
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數(shù) +1
tiani_tan: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 非常感謝，懂了�。� 2015-09-13 22:08:49
感謝參與，應助指數(shù) +1
tiani_tan: 金幣+10, ★★★★★最佳答案, 非常感謝，懂了�。� 2015-09-13 22:08:49
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SSR重復序列motif一般以2-6個堿基為主，重復次數(shù)6-14，也就是ssr長度為12-30bp左右，再加上左右引物 （大概各20幾個堿基），這樣就有60bp以上，考慮設計引物要與ssr間隔15bp以上，加起來差不多100 bp，至于上限300bp，設計引物之后發(fā)現(xiàn)總長度就在這范圍之內(nèi)，太長了擴增出來雜帶更多 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2015-09-13 09:27:44
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3樓2015-09-13 13:40:15
nimaquzhen
木蟲 (小有名氣)
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4樓2020-11-27 19:50:06
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