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分子微生物生態(tài)學(xué)及環(huán)境基因組技術(shù)培訓(xùn)班
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分子微生物生態(tài)學(xué)及環(huán)境基因組技術(shù)培訓(xùn)班 成都斯納普生物科技有限公司聯(lián)合中國科學(xué)院成都生物研究所于2015/11/7-11/8日舉辦《分子微生物生態(tài)學(xué)及環(huán)境基因組》技術(shù)培訓(xùn)班,歡迎全國生命科學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、農(nóng)林科學(xué)等領(lǐng)域大專院校、科研機構(gòu)、公司企業(yè)從事分子生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳學(xué)、基因組學(xué)等研究、開發(fā)和教學(xué)的第一線研發(fā)人員和青年教師、博士后和高年級研究生參加。歡迎您報名參加! 本次培訓(xùn)班主講人均邀請具有實際的環(huán)境基因組和生物信息學(xué)的科研經(jīng)驗,培訓(xùn)過程中互動性強,理論與實際操作結(jié)合緊密,培訓(xùn)中可實際操作基本生物信息分析、個性化分析等上機操作。 主辦單位:成都斯納普生物科技有限公司 舉辦地:成都 培訓(xùn)時間:2015年11月7日-8日 成都站(報名中) 培訓(xùn)內(nèi)容及安排: 日期 課程名稱 課程內(nèi)容 第一天 分子微生物生態(tài)學(xué)基礎(chǔ) 1、物種進化的“三域?qū)W說” 2、群落結(jié)構(gòu)與多樣性 環(huán)境基因組技術(shù)基礎(chǔ) 測序技術(shù),生物信息學(xué) 測序技術(shù)原理及應(yīng)用 1、以二代測序平臺Illumina Miseq 2、同時介紹三代Pac Bio測序技術(shù) Bioedit軟件應(yīng)用 NCBI Blast簡介 1、Bioedit軟件應(yīng)用 2、NCBI Blast簡介 高通量測序樣品準(zhǔn)備操作流程 1、生物樣本采集 2、樣本基因組DNA/RNA提取 3、高通量引物的選取 4、PCR擴增、產(chǎn)物回收及混樣 5、建庫及上機測序 利用Qiime平臺處理測序數(shù)據(jù) 1、Qiime及相關(guān)軟件介紹 2、FLASH軟件進行序列拼接 3、去雜,提取barcoded序列,去除chimera,重取樣 4、OTU及代表性序列的生成,物種分類 5、進化樹構(gòu)建 6、群落組成及結(jié)構(gòu)差異分析 7、alpha多樣性,beta多樣性分析 提交序列到數(shù)據(jù)庫 1、數(shù)據(jù)庫介紹 2、提交序列到European Nucleotide Archive 第二天 宏基因組數(shù)據(jù)分析原理及平臺介紹 宏基因組數(shù)據(jù)分析原理及平臺介紹 MG-RAST平臺分析宏基因組數(shù)據(jù) 1、物種組成及豐度分析 2、功能基因組成及分類分析 3、代謝通路分析 生態(tài)統(tǒng)計學(xué)方法培訓(xùn) 生態(tài)統(tǒng)計學(xué)方法培訓(xùn) 微生物菌群之間,以及微生物菌群與環(huán)境因子之間的相互關(guān)系分析 1、相關(guān)性分析:Pearson correlation, (Partial) Mantel test 2、排序分析:PCoA、NMDS、CCA 3、方差分析:ANOVA、PERMANOVA、variance partitioning analysis(VPA) 4、因果關(guān)系:Pathway analysis (PLS-PM) 【收費標(biāo)準(zhǔn)】 注冊費:2500元/人,請自帶筆記本電腦。 主辦方可協(xié)助安排入住酒店,食宿費用自理 培訓(xùn)座位按收到報名表先后順序安排。 【付費方式】現(xiàn)金、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款 單位全稱:成都斯納普生物科技有限公司 賬號:4402256009100238131 開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司成都武侯祠支行 (匯款信息里 備注上:“您的姓名”) 【聯(lián)系咨詢】 電話:028-85100772,郵箱:2053490164@qq.com 張玉祥:18782059376,郵箱:64904709@qq.com 母桂諤:15196645188,郵箱:549897101@qq.com |

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