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HPLC2008

木蟲(chóng) (正式寫手)

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[求助] 計(jì)算ECD出錯(cuò),求高手指點(diǎn)! 已有3人參與

本人菜鳥(niǎo),想用gaussian 09計(jì)算ECD幫助確定構(gòu)型結(jié)果出錯(cuò),求指點(diǎn)
input
*****************************************
%chk=/home/zjc/input/3622.chk
%nprocshared=8
Will use up to 8 processors via shared memory.
%mem=5000MB
-------------------------------------------------------------
#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm
-------------------------------------------------------------

錯(cuò)誤:
rnie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.
======================================================================================================
                                    Pseudopotential Parameters
======================================================================================================
  Center    Atomic    Valence    Angular    Power
  Number    Number    Electrons    Momentum    of R    Exponent       Coefficient SO-Coeffient
======================================================================================================
EOF while reading ECP pointer card.
Error termination via Lnk1e in /home/zjc/g09/l301.exe at Mon Sep 14 20:33:37 2015.
錯(cuò)誤2:

======================================================================================================
                                    Pseudopotential Parameters
======================================================================================================
  Center    Atomic    Valence    Angular    Power
  Number    Number    Electrons    Momentum    of R    Exponent       Coefficient SO-Coeffient
======================================================================================================
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A FLOATING POINT NUMBER AS INPUT.
  1 2 1.0 6 1.0 60 1.0 67 1.0
  ?
Error termination via Lnk1e in /home/zjc/g09/l301.exe at Mon Sep 14 20:25:41 2015

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1樓 2015-09-14 21:23:25

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qchem

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【答案】應(yīng)助回帖

不是方法，就是輸入文件的問(wèn)題

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7樓2015-09-17 06:21:09

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普通回帖

qchem

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
HPLC2008: 金幣+4, ★有幫助, 能講清楚點(diǎn)嗎？ 2015-09-15 11:06:49

你的輸入文件有問(wèn)題，再仔細(xì)看看
它要整型數(shù)據(jù)，你給了個(gè)實(shí)型

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2樓2015-09-15 06:25:59

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HPLC2008

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引用回帖:

2樓: Originally posted by qchem at 2015-09-15 06:25:59
你的輸入文件有問(wèn)題，再仔細(xì)看看
它要整型數(shù)據(jù)，你給了個(gè)實(shí)型

能不能講清楚點(diǎn)，意思是我的結(jié)構(gòu)給的有問(wèn)題嗎

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3樓2015-09-15 11:07:17

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qchem

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引用回帖:

3樓: Originally posted by HPLC2008 at 2015-09-15 11:07:17
能不能講清楚點(diǎn)，意思是我的結(jié)構(gòu)給的有問(wèn)題嗎...

要看完整的輸入文件才能看出錯(cuò)在哪里

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4樓2015-09-15 13:31:14

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wbfeng721

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
HPLC2008: 金幣+4, ★有幫助, 謝謝 2015-09-16 22:11:56

贗勢(shì)的寫法出錯(cuò)，好好讀說(shuō)明書(shū)

[ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ]

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5樓2015-09-15 20:09:04

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引用回帖:

4樓: Originally posted by qchem at 2015-09-15 13:31:14
要看完整的輸入文件才能看出錯(cuò)在哪里...

我用來(lái)優(yōu)化,又可以計(jì)算,就是用"#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm"計(jì)算ECD,就不行,是不是我計(jì)算ECD的方法出了問(wèn)題呀

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6樓2015-09-16 22:16:09

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小范范1989

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你把你的輸入文件貼出來(lái)，因?yàn)樘崾揪褪悄愕内I勢(shì)機(jī)組有問(wèn)題，應(yīng)該是你輸入文件最后沒(méi)有定義。你把你完整的輸入文件貼出來(lái)。

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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.

8樓2015-09-17 06:47:21

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8樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-09-17 06:47:21
你把你的輸入文件貼出來(lái)，因?yàn)樘崾揪褪悄愕内I勢(shì)機(jī)組有問(wèn)題，應(yīng)該是你輸入文件最后沒(méi)有定義。你把你完整的輸入文件貼出來(lái)。

好,主要我在外面,電腦上沒(méi)有帶著輸入文件,要在計(jì)算的電腦上才有,謝謝

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9樓2015-09-18 22:13:30

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%chk=/home/zjc/input/3622.chk
%nprocshared=8
%mem=5000MB

#p B3LYP/6-31g*/gen pseudo=read td(direct nstates=100) nosymm

3622

0 1
C                3.94931600 -0.20724400 1.47431200
C                4.31607500 -0.22708400 -0.02837800
C                3.12823100 -0.48461000 -1.00379500
C                2.15921200 -1.53835700 -0.39901200
C                1.89024200 -1.35143300 1.10482100
O                3.11747300 -1.29917700 1.83628000
O                0.94588000 -1.51712500 -1.10960500
C                0.01822300 -2.56674400 -0.75561700
C                -0.18773900 -2.70358200 0.76313700
C                1.05646900 -2.51359800 1.62584600
C                -1.36144200 -2.09454800 -1.26963800
C                -2.10276700 -1.63763400 0.03333200
O                -1.14970800 -1.67900600 1.08249000
O                5.28672100 -1.24871600 -0.24272100
O                2.82751600 -2.79347900 -0.52620600
C                3.49218600 1.16462700 1.98794700
N                -2.65976500 -0.30143900 -0.02145300
C                -4.00259100 0.02320500 -0.03960600
C                -4.03904500 1.42043300 -0.07411800
N                -2.75872400 1.95104900 -0.06575800
C                -1.97302100 0.89910900 -0.03484600
N                -5.05642600 -0.80571300 -0.02537200
C                -6.20846100 -0.12735800 -0.04414300
N                -6.40311200 1.20083000 -0.07884800
C                -5.32226100 2.00849700 -0.09728300
O                2.32319710 1.54403789 1.46378365
O                4.08938940 1.76773694 2.85864911
C                1.78736195 2.78947110 1.95683896
N                -5.51010400 3.34922700 -0.17462500
H                4.89495900 -0.39051500 1.99847500
H                4.79062800 0.71941700 -0.29355800
H                1.34550800 -0.41565100 1.22254600
H                0.34266700 -3.50390300 -1.21478700
H                -0.63234400 -3.68818000 0.96732300
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H                1.64983300 -3.43181700 1.60347300
H                -2.95056300 -2.30238000 0.23313600
H                4.82834200 -2.09448000 -0.07922100
H                2.93306800 -2.98234000 -1.47593500
H                -0.89216200 0.93001500 0.00147400
H                -7.11482800 -0.72976700 -0.02815400
H                0.82847471 2.91145647 1.45454847
H                2.45947641 3.61237353 1.70491155
H                1.65190100 2.74285755 3.03970264
H                -4.73291000 3.96119800 0.03119000
H                -6.43746900 3.70481200 0.01435000
O                -2.09909100 -3.01045900 -2.05235100
C                -2.33241300 -4.30893300 -1.51255100
H                -2.93410100 -4.83753400 -2.25474100
H                -1.39951300 -4.86577000 -1.35720400
H                -2.89147400 -4.28040200 -0.56843300
H                -1.20630100 -1.23680400 -1.92713300
O                3.72922401 -1.09962007 -2.14636667
C                4.82819353 -0.30217533 -2.59497327
O                5.03605889 0.83152178 -2.08990553
C                5.76051845 -0.83260080 -3.69997059
C                6.94402408 0.02618584 -4.18308539
H                7.59180827 -0.34235653 -4.95084326
C                7.19840477 1.41357740 -3.56499550
H                8.06486233 1.85116844 -4.01517922
H                6.35021228 2.04233252 -3.73859417
H                7.35688466 1.31119770 -2.51176119
C                5.51339981 -2.21886535 -4.32351127
H                5.41680471 -2.12058915 -5.38460088
H                6.33750365 -2.86318157 -4.09854577
H                4.61419180 -2.63600875 -3.92062625
H                2.64747893 0.43220648 -1.27439615

1 2 1.0 6 1.0 16 1.0 30 1.0
2 3 1.0 14 1.0 31 1.0
3 4 1.0 53 1.0 67 1.0
4 5 1.0 7 1.0 15 1.0
5 6 1.0 10 1.0 32 1.0
6
7 8 1.0
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