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XYwinne金蟲 (小有名氣)
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[求助]
建立菱形盒子
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我建了一個菱形的盒子，命令如下 editconf -f 1.pdb -bt triclinic -box ** ** ** -c -angle 90 90 120 -o 2.pdb genbox -cp 2.pdb -ci 1.pdb -nmol 19 -o 3.pdb （加入另外19個溶質(zhì)） genbox -cp3.pdb -ci 4.pdb -nmol 1000 -o 5.pdb （加入1000個溶劑） 在VMD和MS中看圖形，溶質(zhì)和溶劑好像還是按照立方形加入的（圖形如下），之前沒做過斜的盒子，不知道怎么處理？ （左邊的幾個分子是右邊的，由于周期性出現(xiàn)在左邊） 1.PNG |
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