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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » LAMMPS/DL_POLY » npt問題
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809011916銅蟲 (小有名氣)
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npt問題 已有1人參與
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各位大俠好，最近使用lammps做一些相平衡問題。首先使用的是分子動力學的方法，先對初始構型進行最小化及nvt到較高溫度，然后再使用npt在指定溫度壓力下對系統(tǒng)進行平衡。遇到的問題如下：文獻中提到npt可以使體系沿z軸增長，到達一定體積后保持成圖附圖所示的狀態(tài)。 我在初始npt模擬當中，因為沒有考題細節(jié)上的原理，使用了fix 1 all npt temp * * 100.0 iso * * 1000.0的命令，結果體系并沒有發(fā)生體積上較大的變化。于是考慮到在z軸進行平衡，于是進行了調整使用fix 1 all npt temp * * 100.0 z * * 1000.0 drag 0.0的命令，發(fā)現(xiàn)體系（600分子）在z軸上進行了較大體積的變化，在跑了50ps后z軸長度都上萬埃，這顯然與文獻中的結果不符。于是再進行文獻調查調查，發(fā)現(xiàn)有人在x，y軸施加了不同的壓力（如100atm，當z軸是1atm時），這樣可能更容易進行體積上沿z的拉伸，于是又進行調整使用fix 1 all npt temp * * x 100.0 100.0 1000.0 y 100.0 100.0 1000.0 z 1.0 1.0 1000.0 drag 0.0，結果顯示x y的長度在減小，而z軸確實在拉伸，這樣跑了50ps，但是似乎這種變化趨勢并沒有盡頭，也不知道究竟該什么時候停止了。 請問各位大俠（1）如何實現(xiàn)Z軸的拉伸？（2）最后判定壓力穩(wěn)定如何判定？（3）我在模擬中出的問題是什么，為什么會出現(xiàn)趨勢停不下來的結果？ 這個問題對我來說特別重要，請路過的大俠、大神不吝賜教！至少提出有建設性的建議！先在此謝過了！��！ 平衡.jpg |
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新蟲 (小有名氣)
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3樓2016-01-05 06:37:40
2樓2015-12-18 20:20:54
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