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lkyelf新蟲 (初入文壇)
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[求助]
計(jì)算某種離子液體與丁醇、水的相互作用,得到離子液體對(duì)這兩種物質(zhì)的選擇性 已有1人參與
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| 各位MS的大神們好,本人初學(xué)MS與分子模擬,我想要計(jì)算某種離子液體與丁醇、水的相互作用,得到離子液體對(duì)這兩種物質(zhì)的選擇性應(yīng)該怎么算?之前我是通過(guò)對(duì)離子液體、水、丁醇分子建模并用fotcite模塊對(duì)它們分別進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,先分別用forcite模塊的Energy計(jì)算三個(gè)各自的能量(力場(chǎng)是選擇的COMPASS II),再把離子液體與水,離子液體與丁醇放在一起,計(jì)算他們的總能量,那么,相互作用能=總能量-離子液體能量-水(或丁醇)的能量,這樣的做法對(duì)嗎?我在計(jì)算水分子單獨(dú)能量的時(shí)候,計(jì)算結(jié)果是0,這樣對(duì)嗎?哪里出了問(wèn)題?或者還有什么其他的方法可以得到離子液體對(duì)這兩種物質(zhì)的選擇性? |
新蟲 (著名寫手)
新蟲 (初入文壇)
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你好,你提的意見很對(duì),我們只是想從幾十種離子液體中用這個(gè)理論計(jì)算的方法挑選出一兩種對(duì)丁醇選擇性較好的離子液體來(lái)進(jìn)行實(shí)驗(yàn),避免實(shí)驗(yàn)工作量過(guò)大,并不是做比較專業(yè)的分子模擬。溶劑方面確實(shí)沒(méi)有考慮,因?yàn)槲覀冏鰸B透汽化實(shí)驗(yàn)的話過(guò)的是氣體,溫度的話再計(jì)算能量的時(shí)候有輸入溫度的。我這個(gè)是之前參加一個(gè)MS培訓(xùn)班的時(shí)候跟老師提問(wèn)他給我說(shuō)的預(yù)方案,我計(jì)算下來(lái)也覺(jué)得不太對(duì),或者你有沒(méi)有什么較好的意見呢? |
新蟲 (初入文壇)
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