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紫痕墨軒金蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
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請(qǐng)教各位蟲(chóng)友，做了一個(gè)植物與菌共生后尋找差異表達(dá)基因的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，植物是紫穗槐（豆科，木本植物），菌是摩西球囊霉（一種叢枝菌根真菌AMF）,加菌為處理組，不加菌為對(duì)照組，菌與植物之間為共生關(guān)系，接種摩西球囊霉對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育、抗逆性（耐干旱）等方面有促進(jìn)作用，現(xiàn)在做完轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)有上調(diào)基因800多，下調(diào)基因1500多，我想問(wèn)大家的是，分析下調(diào)基因有什么意義，以下是個(gè)人理解：（下調(diào)的意思不是指基因的表達(dá)量處理組比對(duì)照組低，代表基因受到負(fù)向調(diào)控，受到抑制么，而加菌后會(huì)促進(jìn)植物的各個(gè)方面，我就是不清楚為什么要分析下調(diào)基因，下調(diào)基因豈不是說(shuō)明加菌后，處理組還沒(méi)對(duì)照組好么），就是這塊蒙圈了，所以要請(qǐng)教大家，可能說(shuō)的有點(diǎn)亂，還請(qǐng)大家見(jiàn)諒。先謝過(guò)大家了。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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紫痕墨軒: 金幣+50, ★★★很有幫助 2015-10-18 12:08:40
紫痕墨軒: 金幣+50, ★★★很有幫助 2015-10-18 12:08:40
| 有差異表達(dá)的基因都是要分析的，無(wú)論高表達(dá)還是低表達(dá)。不明白樓主為何困惑。舉個(gè)栗子，加入A基因可抑制抗旱能力，如果A基因高表達(dá)，則植物抗旱能力差，低表達(dá)則抗旱能力強(qiáng)。那么A基因在處理組中低表達(dá)就很有意義！ |
2樓2015-10-17 23:36:41
qijinyu
鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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請(qǐng)問(wèn)，你做的是植物的什么部位是葉部嗎？根部是不是菌根菌會(huì)對(duì)結(jié)果有影響 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
3樓2016-01-04 18:18:08
gmufan
新蟲(chóng) (初入文壇)
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4樓2016-01-12 11:29:52
夢(mèng)與命
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5樓2019-09-26 23:42:30
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