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調(diào)查：《計(jì)算晶體學(xué)》 已有17人參與
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本人在學(xué)校開(kāi)設(shè)研究生課程《計(jì)算晶體學(xué)》，但是國(guó)內(nèi)外沒(méi)有現(xiàn)成教材。我打算寫(xiě)一本，不知道大家感覺(jué)需不需要？想調(diào)查一下。 基本內(nèi)容：介紹在晶體學(xué)里進(jìn)本的公式、理論及計(jì)算算法。有部分核心代碼（Fortran, Visual Basic開(kāi)發(fā)） 第一章 原子散射因子及結(jié)構(gòu)因子 主要介紹原子散射原理，9系數(shù)法原子散射因子計(jì)算公式，國(guó)際晶體學(xué)表C卷原子散射因子列表，計(jì)算代碼 第二章 群論，空間群 主要介紹群論進(jìn)本知識(shí)，群論的矩陣表達(dá)方法及公式，編寫(xiě)原子坐標(biāo)對(duì)稱(chēng)性操作計(jì)算代碼。 （完成前兩章后，可以獨(dú)立編寫(xiě)單晶衍射，粉末衍射模擬計(jì)算軟件） 第三章 Fourier變換及卷積理論 （沒(méi)啥好說(shuō)的） 第四章 晶體結(jié)構(gòu)解析方法 介紹三種晶體結(jié)構(gòu)解析方法的理論背景，原理。 1 直接法 2 Patterson法，3 charge flipping法（HIO/ER法） （完成三、四章可以獨(dú)立編寫(xiě)charge flipping及patterson算法代碼） 第五章 圖像清晰度理論及其應(yīng)用 從Abbe原理出發(fā)，換個(gè)角度看待晶體結(jié)構(gòu)解析問(wèn)題及結(jié)構(gòu)解析方法。詳見(jiàn)精華帖 第六章 最大熵理論及其在晶體學(xué)中的應(yīng)用 介紹最大熵基本理論，計(jì)算公式，代碼設(shè)計(jì)。介紹用最大熵理論進(jìn)行晶體電荷密度分析基本過(guò)程，研究晶體中的化學(xué)鍵性質(zhì)研究（如離子鍵，共價(jià)鍵，金屬鍵的確 定，電負(fù)性的確定，AIM理論） 第七章 I.Brown的價(jià)鍵理論 介紹價(jià)鍵理論，用該理論研究鋰離子電池材料的離子通道的基本方法及計(jì)算代碼 第八章 密度泛函理論 重點(diǎn)介紹我們?cè)O(shè)計(jì)的無(wú)軌道密度泛函（Orbital Free-DFT）計(jì)算代碼 上述各章節(jié)我們都給出我們?cè)O(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)的代碼作為參考，以助于大家掌握或應(yīng)用 |
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
sty112: 金幣+5, 鼓勵(lì)交流 2016-01-19 13:21:45
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
sty112: 金幣+5, 鼓勵(lì)交流 2016-01-19 13:21:45
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個(gè)人建議如下： （1）大部分計(jì)算的理論和代碼等有公用的代碼庫(kù)可以調(diào)用，比如FOX、Fullprof等都是基于這些代碼庫(kù)發(fā)展的，作為教材，我覺(jué)得應(yīng)該提及，讓學(xué)生有所選擇，如果能介紹使用，則更好了； （2）計(jì)算晶體學(xué)的基本東西不要拋棄——因?yàn)榇蠖鄶?shù)論文，所需要的實(shí)際上就是鍵長(zhǎng)鍵角、晶胞大小、晶面間距、晶面原子密度等基本的東西，對(duì)于晶體學(xué)家來(lái)說(shuō)，這是小兒科，但是對(duì)于搞材料的，這卻是大問(wèn)題——他們拿著cif文件都不知道如何算！假定有人使用你這本書(shū)發(fā)展晶體計(jì)算的軟件，這些基本的反而是必須提供的功能； （3）晶體結(jié)構(gòu)解析方法應(yīng)該添加正空間法；圖像清晰度的介紹應(yīng)該考慮傳統(tǒng)的R因子以及各類(lèi)改進(jìn)的R因子，比如導(dǎo)數(shù)最小值R因子； 總體上說(shuō)，我覺(jué)得你提的內(nèi)容更像一本專(zhuān)著，或者屬于高級(jí)別研究生用的教材，（收親傳徒弟使用的武林秘籍，開(kāi)宗立派，^_^）。 以上純屬個(gè)人拙見(jiàn)，還請(qǐng)不要見(jiàn)怪 |
3樓2015-10-13 09:47:02
cycleuser
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8樓2015-11-23 10:47:05
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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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國(guó)際晶體學(xué)表如何使用應(yīng)該給出一些具體而詳細(xì)的指導(dǎo)。否則大部分人還是不會(huì)用。 群論很重要，現(xiàn)在的講法只能讓人接受已有的結(jié)果，似乎很難利用群論工具去開(kāi)展新的研究-比如，如何從分子對(duì)稱(chēng)性推測(cè)晶體空間群。 實(shí)空間解析晶體結(jié)構(gòu)對(duì)于有機(jī)分子晶體而言不難，用波譜、光譜和元素分析就能知道分子的初始結(jié)構(gòu)，只要指標(biāo)化正確，余下的就是計(jì)算機(jī)自動(dòng)搜索的精修過(guò)程�，F(xiàn)在計(jì)算機(jī)能力提高，如果有并行或者GPU加速，那做網(wǎng)格搜索更保險(xiǎn)。 期待盡快出版。 |
10樓2015-12-07 09:56:58
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