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liuya0707新蟲 (初入文壇)
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[求助]
微生物的群落豐富度和群落多樣性有什么差別？ 已有1人參與
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群落豐富度（Community richness）的指數(shù)，包括Chao 指數(shù)和ACE 指數(shù) Chao指數(shù)：是用Chao1 算法估計(jì)樣品中所含OTU 數(shù)目的指數(shù)，Chao1 在生態(tài)學(xué)中常用來估計(jì)物種總數(shù)，由Chao（Pitta DW等，2010）最早提出。 ACE指數(shù)：用來估計(jì)群落中OTU數(shù)目的指數(shù)，由Chao提出，是生態(tài)學(xué)中估計(jì)物種總數(shù)的常用數(shù)之一，與Chao1的算法不同（Pitta DW等,2010）。 Chao 或ACE指數(shù)越大，說明群落豐富度越高。 群落多樣性（Community diversity）的指數(shù)，包括Shannon 指數(shù)和Simpson指數(shù)。 Shannon指數(shù)：用來估算樣品中微生物多樣性指數(shù)之一。它與Simpson多樣性指數(shù)常用于反映alpha多樣性指數(shù)。Shannon值越大，說明群落多樣性越高。 Simpsin指數(shù)：用來估算樣品中微生物多樣性指數(shù)之一，由Edward Hugh Simpson提出，在生態(tài)學(xué)中常用來定量描述一個(gè)區(qū)域的生物多樣性。Simpson指數(shù)值越大，說明群落多樣性越低。 但是這四個(gè)指數(shù)分析出來的結(jié)果有差異，想請問各位前輩，應(yīng)該以哪個(gè)為準(zhǔn)？群落豐富度和群落多樣性是一個(gè)意思嗎？麻煩告知一下~~ |
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liuya0707
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2樓2015-10-17 10:01:24
xiaoma0556
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【答案】應(yīng)助回帖
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豐度和多樣性當(dāng)然不一樣 豐度指的是你這里面有多少類的菌，豐度越高，微生物種類越多，越豐富，正常情況下Chao1和OTU的趨勢一致 Shannon和 Simpsin的數(shù)值是相反的關(guān)系，多樣性指的是每個(gè)菌分布的均勻度，說一個(gè)shannon即可，大體上shannon指數(shù)和OTU數(shù)有一定的正相關(guān)吧，趨勢沒有完全一致的，都沒啥關(guān)系，該是多少是多少。 可參考我的文章，http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0960852414017866 |
3樓2015-12-23 17:04:31
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