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liqing1910木蟲 (著名寫手)
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[求助]
用chembio3d將小分子進(jìn)行MM2能量優(yōu)化后，存為mol2文件,再用DS與蛋對接，對接不上 已有1人參與
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用chembio3d將小分子進(jìn)行MM2能量優(yōu)化后，存為mol2文件,再用DS與蛋白對接，對接不上，而用DS將小分子進(jìn)行優(yōu)化后能夠?qū)由�，但是用兩種不同方法優(yōu)化后的分子結(jié)構(gòu)差別挺大的，怎樣能使chembio3d優(yōu)化后的小分子能用DS與蛋白對接呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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xiaomengyeyu
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【答案】應(yīng)助回帖
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兩者參數(shù)不一樣，你可以先試試chemdraw3D再保存成mol2格式文件導(dǎo)到sybyl中再優(yōu)化好一點 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2015-12-20 00:24:11
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