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三代測序、基因芯片、大數(shù)據(jù)分析管理服務 已有1人參與
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�？司S爾簡介： 海克維爾基因（北京）研究院是一家專業(yè)從事生物科學、轉化醫(yī)學及腫瘤早期診斷研究的科研服務機構；目前研究院建立了基于基因組學及細胞組學為主的系統(tǒng)生物學平臺，配備了包括PacBioRSII 三代測序儀、Affymetrix 高通量基因芯片、Leica 白激光共聚焦顯微鏡、PE 高內(nèi)涵成像系統(tǒng)在內(nèi)的領先儀器，可對外進行基因診斷、生化免疫檢測、大數(shù)據(jù)分析等服務，為公眾提供癌癥和糖尿病的早期輔助診斷與篩查及慢病精準化大健康管理服務。 第三代測序平臺簡介-單分子實時測序 PacBio RS II 測序平臺介紹 PacBio RS II是Pacific Biosciences公司研發(fā)的單分子實時測序系統(tǒng)（Single Molecule Real Time, SMRT）。在測序歷史上首次實現(xiàn)了人類觀測單個DNA聚合酶合成過程的夢想。使研究者第一次能夠利用單個 DNA 聚合酶對天然DNA 的合成進行大規(guī)模平行的、連續(xù)的實時觀察。它讓科學家能夠快速經(jīng)濟地完成基因組組裝、揭示并了解表觀基因組，以及鑒定基因組變異，是基因組從頭測序的最佳選擇。 PacBio RS II系統(tǒng)的讀長為業(yè)內(nèi)最長，能夠達到深度覆蓋且精確度高。利用最新的試劑，PacBio RS II的平均讀取長度可達10 kb-15 kb，且每個SMRT cell能產(chǎn)生500 Mb-1 Gb的數(shù)據(jù)。在準確度方面，SMRT DNA測序可以實現(xiàn)超過99.999%（QV50）的高度精確測序，且不受DNA序列中GC和AT含量的影響。這些特點讓用戶可以獲得完整的序列變異類型，檢測單核苷酸多態(tài)性和復雜的結構變異，以及此前無法檢測到的基因組區(qū)域。此外，SMRT測序技術也是目前唯一一個可以跨越完整基因序列和染色體單倍體型直接檢測堿基修飾和鑒定變異信息的技術。 PacBio RS II 測序系統(tǒng)服務領域 基因組測序 (1) 由于具有讀長長的特點，SMRT測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數(shù)量，明顯減少后續(xù)的基因組拼接和注釋的工作量，節(jié)省大量的時間。 (2) Pacbio RSII系統(tǒng)提供長片段讀長全面解讀基因組的復雜度，包括稀有SNP，缺失，結構變異和單倍體等。 長片段讀長對這些應用必不可少，對有變異的序列如果僅有短片段的讀序會由于定位錯誤或定位不明確而無法確定真實的變異，甚至得出錯誤結果。此外，短片段讀序也無法測定大片段的結構變異的準確位置，大小及等位序列。 細菌基因組完成圖 (1) 普通細菌快速完成圖構建； (2) 尤其適合超高GC/超低GC細菌； (3) 其它用傳統(tǒng)方法測序比較困難細菌菌株。 該平臺是目前唯一能完成完整基因組組裝，結構測定和基因分型的微生物測序平臺。實際應用中，大家普遍用PacBio序列拼Contig，再用Illumina的序列來修正堿基，從而將PacBio長讀長數(shù)據(jù)和二代測序短讀長數(shù)據(jù)進行混合拼接完成基因組。 從頭組裝（DE Novo Assembly） 該平臺是目前唯一能完成完整基因組組裝，結構測定和基因分型的微生物測序平臺。因為讀長很長，所以在拼Contig時，成功率很高，可以拼出很長的Contig。并且可以輕松跨過重復序列、高GC序列，實現(xiàn)序列覆蓋的完整性和均一性。。 修飾堿基測定 DNA堿基修飾，例如DNA甲基化，是基因表達，宿主-病原反應，DNA損傷和修復等許多重要生命過程中的關鍵因素。與其他技術相比，PacBio RSII系統(tǒng)能夠?qū)崟r觀測到每個單核苷酸的添加，在測序過程中同時檢測堿基集合的動力學信息，從而直接測定不同堿基，不同基團的多種修飾。 RNA測序 單分子測序技術最大的優(yōu)勢，也是最直接的應用就是檢測細胞和組織內(nèi)基因表達水平，同時對基因的結構做出分析，如RNA的剪接，是否有堿基突變或異常表達基因等。 HLA分型 人體器官移植中，準確的HLA分型很重要。HLA是一個長片段，而且單體型對配型成功、移植成功有重要意義�，F(xiàn)在醫(yī)學上正在嘗試用PacBio的序列來為HLA準確分型提供解決方案。 PacBio RS II 測序系統(tǒng)優(yōu)勢 完成基因組測序、靶向測序、二代測序數(shù)據(jù)混合拼接、修飾堿基測序、轉錄組分析等的最佳選擇。 無以倫比的讀長； 沒有GC偏好； 操作流程簡便； 更精細的測序； 數(shù)據(jù)分析方便； 獨有的動力學信息； PacBio RS II 測序數(shù)據(jù)分析服務 針對PacBio RS II 測序數(shù)據(jù)我們提供數(shù)據(jù)分析服務，其中包括原始數(shù)據(jù)的一級、二級及三級分析，可以根據(jù)客戶需求及研究方向，制定“個性化”的數(shù)據(jù)分析服務。 聯(lián)系我們 聯(lián)系人：王翠芳 王秋艷 聯(lián)系電話：010-61824292 010-61824285 18510608628 電子郵箱：wqy_hikewell@163.com |
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hui113sheng
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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很好，請把資料發(fā)我郵箱一份好嗎？huisheng113905@163.com 謝謝，我是做細菌的，正好有一批要測序 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
2樓2015-10-25 14:06:39
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