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lylyly2006木蟲 (正式寫手)
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[交流]
關(guān)于構(gòu)建載體移碼問題 已有3人參與
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設(shè)計(jì)引物構(gòu)建載體后測序，通過測序結(jié)果怎樣去檢測有沒有移碼問題，就是怎么看有沒有導(dǎo)致后面的標(biāo)簽蛋白不能表達(dá)。例如我的順序是啟動子+基因+Myc標(biāo)簽蛋白，這個(gè)蛋白編碼是從基因的atg開始，還是rbs。如果是標(biāo)簽蛋白+基因，這個(gè)基因還需要atg嗎？怎么通過測序結(jié)果看有沒有移碼，有沒有軟件推薦 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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nono2009: 金幣-20, 屏蔽內(nèi)容, 違規(guī)存檔, 禁止回帖廣告 2015-10-25 09:57:37
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2樓2015-10-24 06:34:26
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
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無論標(biāo)簽在前在后，都是從啟動子后面的kozak序列后的第一個(gè)atg開始的，至于融合表達(dá)的后面的基因的atg有沒有都沒有關(guān)系，沒有任何影響。測序結(jié)果怎么看有沒有移碼，一般的序列分析軟件都能做到。推薦國人做的BioXM，簡單直觀；或者DNAman，多序列比對功能非常強(qiáng)大。只需要對你的測序結(jié)果做一個(gè)ORF分析就好了，然后和你的目的基因的氨基酸序列對比，后者可手工加上標(biāo)簽翻譯出來的氨基酸序列。以上。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2015-10-24 11:34:38
lylyly2006
木蟲 (正式寫手)
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4樓2015-10-24 12:57:35
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