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介電常數(shù) 已有1人參與
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在gromacs中計算得到的介電常數(shù)是靜態(tài)介電常數(shù)還是動態(tài)介電常數(shù)？ 當(dāng)然，我查了一些資料，知道靜態(tài)介電常數(shù)是在靜電場下得到的，動態(tài)介電常數(shù)是在交變電場下得到的。 但是，不論是靜態(tài)介電常數(shù)還是動態(tài)介電常數(shù)，gromacs中計算得到介電常數(shù)跟實(shí)驗(yàn)上的什么介電常數(shù)相對應(yīng)。 我搜了一下小木蟲的帖子，看到 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3739497&fpage=1&target=blank 但是我還是沒有找到相應(yīng)的對應(yīng)關(guān)系，求大神指導(dǎo)  |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
十年磨練: 金幣+10, ★★★很有幫助 2015-11-04 08:43:33
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是靜態(tài)介電常數(shù)，通常模擬是在無外加電場的平衡態(tài)下進(jìn)行的，介電常數(shù)是通過計算偶極矩的漲落（也就是漲落耗散定理）來得到的。 可以和實(shí)驗(yàn)測量的介電常數(shù)直接對照，例如水的介電常數(shù)常溫下是78，很多模擬也能得到這個值。 動態(tài)的介電常數(shù)其實(shí)是介電常數(shù)隨外加電場頻率的變化，這個計算會更復(fù)雜一些，可能會涉及時間關(guān)聯(lián)函數(shù)的計算，和計算靜態(tài)介電常數(shù)的原理不一樣�？梢月�(lián)系的實(shí)驗(yàn)一般都是可以測dielectric relaxation的實(shí)驗(yàn)。 |
2樓2015-11-03 13:21:40
3樓2015-11-04 08:46:17
lsloneil
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外加恒定電場時，可以通過計算極化強(qiáng)度（外加電場誘導(dǎo)產(chǎn)生的偶極矩）來計算介電常數(shù)，得到的依然是靜態(tài)介電常數(shù)，這個也可以通過平衡態(tài)的分子模擬做。 外加交變電場，理論上依然可以通過計算極化強(qiáng)度來計算動態(tài)介電常數(shù)，但如何在分子模擬中實(shí)現(xiàn)，我不是很清楚，因?yàn)檫@是一個非平衡態(tài)的模擬。 理論上來講，不管是靜態(tài)介電常數(shù)還是動態(tài)介電常數(shù)，都可以通過沒有外加電場的平衡態(tài)模擬來計算，基于的原理都是統(tǒng)計力學(xué)中的線性響應(yīng)（linear response）和漲落耗散定理（flucutation-dissipation theorem）。但計算結(jié)果和實(shí)驗(yàn)相比是否符合則是很技術(shù)性的問題了。 |
4樓2015-11-04 09:23:14
5樓2015-11-04 10:17:16
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我沒用過這個命令，不過看說明應(yīng)該就是計算靜態(tài)介電常數(shù)。 關(guān)于gromacs的詳細(xì)命令可以查看jerkwin組織翻譯的中文手冊：http://jerkwin.github.io/9999/12/31/GROMACS中文手冊/ |
6樓2015-11-04 11:06:06
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