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qaz199018金蟲 (小有名氣)
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[交流]
Genbank登錄號前兩位英文字母代表什么？ 已有1人參與
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| 在Genbank搜索某物種的序列，有些貌似是重復的，提交者、物種、發(fā)表的期刊信息什么的都一樣，具體序列是否一樣沒仔細看（看著眼花），但是登錄號不一樣，有NC_開頭的，還有什么JQ,KR開頭的。。。那我在統(tǒng)計時能把這兩條算作一條嗎，能的話應該用哪條呢？NC_開頭的嗎？謝謝大神�。� |
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/ 最早登陸號是一個字母加5個數(shù)字，后來不夠用，變成現(xiàn)在的2個字母加6個數(shù)字。但是提交的大量序列中有很多冗余序列，為了減小冗余，NCBI就通過利用計算機算法把一致的序列歸并在一起，這些人工生成的序列都是用類似NP_xxxxx的格式編碼，嚴格的編碼規(guī)則是[ANXYZ][CPGMPRTWZS]_([A-Z]{1,4})[0-9]{1,9}。每種的特定含義見鏈接中的 Table I。也就是說你查到的其實是同一條序列，一個登陸號是最早提交時生成的，NC的是計算機二次注釋時生成的。 |
4樓2015-11-08 23:17:31
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21091/ 最早登陸號是一個字母加5個數(shù)字，后來不夠用，變成現(xiàn)在的2個字母加6個數(shù)字。但是提交的大量序列中有很多冗余序列，為了減小冗余，NCBI就通過利用計算機算法把一致的序列歸并在一起，這些人工生成的序列都是用類似NP_xxxxx的格式編碼，嚴格的編碼規(guī)則是[ANXYZ][CPGMPRTWZS]_([A-Z]{1,4})[0-9]{1,9}。每種的特定含義見鏈接中的 Table I |
3樓2015-11-08 23:15:43
qaz199018
金蟲 (小有名氣)
- 應助: 4 (幼兒園)
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- 注冊: 2015-03-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 免疫生物學
5樓2015-11-08 23:27:06
6樓2015-11-09 10:30:27
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