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8913813銅蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
優(yōu)化后chk和log文件的結(jié)構(gòu)鍵不一樣 已有2人參與
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剛接觸高斯不久,優(yōu)化了一個(gè)分子,結(jié)束后我發(fā)現(xiàn)CHK和LOG里面優(yōu)化后的分子成鍵不太一樣,我要用哪一個(gè)呢? NaAB_log.jpg NaAB_chk.jpg |
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銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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1. 正常計(jì)算結(jié)束的.chk和.log文件給出的結(jié)構(gòu)應(yīng)該是一樣的(最后一步)。 2. 你的兩個(gè)圖感覺(jué)就是一個(gè)相同結(jié)構(gòu),只是成鍵不一樣。 這里涉及到一個(gè)關(guān)于“化學(xué)鍵”的概念。常見(jiàn)的視圖軟件只會(huì)根據(jù)兩個(gè)原子之間的距離判斷成鍵情況,如果設(shè)置2Å是單鍵,1Å是雙鍵,那么1.4Å, 1.7Å都會(huì)給你顯示位1.5倍健。 3. 你需要把這兩個(gè)結(jié)構(gòu)重疊一下,應(yīng)該是一樣的原子位置。 |
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