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hshhqu3新蟲 (小有名氣)
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[交流]
學(xué)妹求助
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請各位學(xué)長學(xué)姐,老師,專家等指點一下。非常感謝啊![]() 1.NCBI基因組序列提交時,能提交包含 scaffolds 的序列文件嗎? 測序公司給的基因組測序結(jié)果文件里(fna格式),含有幾十個contigs 和十幾個scaffolds.文件較大,我自己無法把contigs和 scaffolds分開。所以,提交序列時,能將contigs 和 scaffolds 一并提交嗎? 2.能用什么方法來判定contigs里面有多少個chromosomes 和幾個plasmids? |
銀蟲 (初入文壇)
銀蟲 (初入文壇)
新蟲 (小有名氣)
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我傳個文件給你看看哈。一個文件里不但有很多contigs,還有很多scaffolds. 怎么分離開啊。求指點啊。能將所有的contig是 序列提取出來嗎?文件有幾千頁,手工是沒法提取出contigs 序列的。 謝謝 |
新蟲 (小有名氣)
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